之前发表两篇同源建模的帖子，这里和大家一起分享模型检测的方法，Molprobity。Molprobity是个在线模型分析工具，地址为：http://molprobity.biochem.duke.edu/index.php   几乎所有的蛋白结构在发表之前都会经过这个工具检测，目前成为结构生物学中一个比较全面的蛋白结构检测工具。

 

步骤一：上传文件

 

步骤二：加氢原子

步骤三：开始检测模型

步骤四：选择要分析的参数,一般采用默认值

第五步：查看结果,这里有图形分析和具体表格分析。
图形分析讲形象地告诉你那些部位的残基存在问题；
表格分析则给出具体残基的编号。

图形分析结果：


说明：
途中红色部分为较为严重的过近接触 atom clashes
绿色的为不合理的二面角
紫色的球为不合理的Cb
橘黄色的残基为不合理的rotamer

表格分析：


说明：
点击表格第一行蓝色的各个项，即可现实详细信息

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