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高通量测序后的序列fasta文件往往很大,利用EditPlus等打开往往只能打开部分,还有很多会被丢弃掉,导致查询不到。因此,利用python,写了本程序select_fasta(V1.0),可从fasta文档中将特定序列号的fasta序列复制出来,并存储到一个新的到fasta文本中,可以根据序列号批量复制fasta序列。
小程序存贮在百度网盘:
链接:https://pan.baidu.com/s/1YX1DrqKflrtulOSZt2sueA
提取码:d2kl
使用说明: 1. 将(1) 含有序列号txt文件"
(2) 含有fasta序列的txt文档"
(3) 本程序select_fasta.exe
放在任一文件夹中,双击后根据提示操作即可。
2. 序列号需要存储在txt文件中,每个序列号单独一行。
3. 每一行除序列号外,不要有的其它符号。
注意事项:
1. 本程序仅适用于win10以上操作系统。
2. 结果以fasta格式形式存储在同一个文件夹的txt文件中,请根据提示查看。
致谢:
1. python 社区(https://www.python.org/)。
2. Biopython、colorama软件包的开发者、维护团队及资助者。
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