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如何利用线粒体DNA进行物种鉴定?
李娟 2021-3-26 08:01
答: (1)物种特异性PCR方法,设计基因(如Cyt b,D-loop区等)的物种特异性引物进行扩增鉴定; (2)PCR-RFLP,这是一种简单的鉴定物种间和物种内遗传多样性的方法,目前,常采用的基因序列有Cyt b基因序列,tRNAGlu/Cyt b、16S rRNA/tRNA Val序列,12S rRNA基因序列,D-loop区序列,以及12S rRNA基因和D-loop区之间的 ...
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常见近源种鉴定的方法?
李娟 2021-3-25 08:34
Q:常见近源种鉴定的方法? A: 16S rRNA序列比较保守,一般情况下只能在种以上水平区分,种下水平很难区分,16S rRNA的相似性可能达99%以上,这个时候就无法用于菌种的鉴定。有以下解决办法: 1.进行ANI(average nucleotide identity)分析,即平均核苷酸相似性分析,在全基因组层面进行比较分析,尤其适用于鉴定新 ...
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T6SS研究方向
李娟 2021-3-24 08:09
更多知识点汇总 T6SS主要调节机制与研究方向 T6SS效应蛋白介绍 T4SS生物学功能与研究技术 T4SS生物学功能以及研究方法 T4SS的底物类型及转移方式 研究方向 近年来,在阐明T6SS真核效应子的功能方面取得了显着进展,这有助于更好地了解细菌发病机制的几个方面。然而,我们对许多T6SS分泌毒素的分子机制 ...
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T6SS组分研究机制
李娟 2021-3-23 08:19
更多知识点汇总 T6SS主要调节机制与研究方向 T6SS效应蛋白介绍 T4SS生物学功能与研究技术 T4SS生物学功能以及研究方法 T4SS的底物类型及转移方式 T6SS组分调节机制 T6SS基因簇的表达受各种环境线索调控,许多生物体甚至具有多个具有不同功能的独立调节的T6SS。然而,从结构的角度来看,有趣的是T6SS组 ...
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T6SS-结构组成
李娟 2021-3-22 08:04
更多知识点汇总 T6SS效应蛋白介绍 T4SS生物学功能与研究技术 T4SS生物学功能以及研究方法 T4SS的底物类型及转移方式 T6SS系统可分为三个子结构: (i) membrane complex : 由 TssJ,TssL,TssM(TssJLM)组成,锚定在内膜上并与外膜相连; (ii)baseplate complex(BP):TssE,TssF,TssG,TssK 和 V ...
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T6SS-主要结构蛋白及机制
李娟 2021-3-21 08:28
更多知识点汇总 T6SS效应蛋白介绍 T4SS生物学功能与研究技术 T4SS生物学功能以及研究方法 T4SS的底物类型及转移方式 -这里只有干货 关注我们- 微信号:密码子实验室 T6SSs 标志性蛋白: 蛋白 VgrG 和 Hcp 可以在 T6SS 激活菌株的上清中被检测到,因此将这两种蛋白的分泌当做 T6SS ...
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T6SS-生物学功能
李娟 2021-3-20 09:23
更多知识点汇总 T4SS生物学功能与研究技术 T4SS生物学功能以及研究方法 T4SS的底物类型及转移方式 T6SS效应蛋白介绍 -这里只有干货 关注我们- 微信号:密码子实验室 T6SS概念 VI型分泌系统是一种高度保守的系统,是把效应蛋白直接一步注射到目的细胞的蛋白分泌系统,广泛存在于革兰氏阴性菌中(约1/4) ...
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真核效应蛋白-【T6SS】知识介绍
李娟 2021-3-19 08:31
接上文 霍乱弧菌 霍乱弧菌是一种天然的自由生活细菌,广泛分布于水生环境以及人类宿主的环境中。霍乱弧菌是一种非侵入性肠道病原体;O1和O139血清群引起腹泻病霍乱。首次报道的靶向真核细胞的T6SS毒素是VgrG-1,是一种能够使宿主 细 胞 肌 动 蛋 白 共 价 交 联 的 酶,此酶 与T6SS 依赖的巨噬细胞毒性密切相关。在 ...
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效应蛋白-【T6SS】知识介绍
李娟 2021-3-18 08:18
T6SS概念 VI型分泌系统是一种高度保守的系统,是把效应蛋白直接一步注射到目的细胞的蛋白分泌系统,广泛存在于革兰氏阴性菌中(约1/4),T6SS是膜内的一个完整的分泌装置,它以接触依赖的方式将将毒性效应物质传递给真核细胞和原核细胞,其效应子细胞壁降解酶(murein水解酶)、细胞膜靶向蛋白(磷脂酶和成孔蛋白)以及 ...
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什么是转座子/转座单元?
李娟 2021-3-17 08:59
转座子是一类在细菌染色体、质粒或噬菌体之间自行移动的遗传成分,是基因组中一段特异的具有转位特性的独立的DNA序列。最简单的转座子除专座相关的转座酶外不含有其他功能,称为插入序列(IS),它们是细菌染色体或质粒DNA的正常组成部分。复合型的转座因子称为转座子(transposon,Tn)。这种转座子除转座相关的基因外还 ...
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