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[转载]传统毒理研究+转录组的范例（文后点评）: 胡耿 2020-4-13 21:25; 镉毒害对二倍体小麦的影响及镉响应的分子机制 Qiao K, Liang S, Wang F, Wang H, Hu Z, Chai T. Effects of cadmium toxicity on diploid wheat (Triticum urartu) and the molecular mechanism of the cadmium response . Journal of hazardous materials, 2019, 374: 1-10. 摘自美吉生物论坛 http://interac ...; 2632 次阅读|1 个评论

转录组分析之差异基因筛选：FoldChange+FDR控制: 胡耿 2020-4-11 22:26; 在做转录组分析的时候，对于差异基因筛选中用到的p-adjust不太理解，故从网上搜罗了一些相关资料（已注明出处）。在利用数据比较分析两个样品中同一个基因是否存在差异表达的时候，一般选取两个标准： i）FoldChange FoldChange，就是两样品中同一个基因表达水平的变化倍数。可以用RPKM、FPKM或TPM值来计算。实验 ...; 33944 次阅读|没有评论

植物的顶替生长: 胡耿 2020-4-10 00:09; 还是那株右旋生长的藤蔓植物，不小心弄断了它的顶端，而顶端是植物的增生组织，对其生长具有重要作用，没有了顶端，它该怎么办呢？首先，它把损伤的顶端螺旋弯曲（注意还是右旋），逐渐退化，大约花费5-6天时间；期间，从顶端临近的一个腋窝部位生长出一个叶芽，用来替代损伤的顶端。估计其中也涉及相关基因的调控，在基因 ...; 1539 次阅读|没有评论

植物的倔脾气之右旋生长: 胡耿 2020-4-9 23:23; 家里有一株藤蔓植物（不认识，有认识的可留言告知），偶然发现其枝蔓都是右旋生长，我做了个小实验，按左旋方式固定，十多个小时之后便可逆袭，感觉很有意思！从网上搜一下，发现左旋或右旋生长的植物还不少，有猜测是在植物的演化过程中由地球自转形成的……估计其中肯定也涉及基因的调控，对植物方面不太了解，不知有没 ...; 1847 次阅读|没有评论

生物信息启蒙课——陈润生: 胡耿 2020-4-9 09:34; 导师推荐的生物信息学视频，老先生厚积薄发，侃侃而谈，信手拈来，融会贯通，把枯燥的学术课讲得有声有色，是我的一堂启蒙课。视频地址： https://v.youku.com/v_show/id_XMzg4MDQ0MDI0.html?tpa=dW5pb25faWQ9MTAyMjEzXzEwMDAwMl8wMV8wMQ 这是第一堂课，感兴趣的话大家可搜索观看。; 1453 次阅读|没有评论

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