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ISME:南农沈其荣团队基于大数据准确判断枯萎病是否发生
刘永鑫 2020-7-18 18:09
基于大数据整合微生物群落可以准确的判断枯萎病是否发生 Predicting disease occurrence with high accuracy based on soil macroecological patterns of Fusarium wilt Article,2020-07-17 The ISME Journal, DOI: https://doi.org/10.1038/s41396-020-0720-5 第一作者:Jun Yuan(袁军), Tao Wen( ...
个人分类: 作者解读|6081 次阅读|没有评论
CMJ:人类微生物组研究设计、样本采集和生物信息分析指南
刘永鑫 2020-7-14 22:15
人类微生物组研究设计、样本采集和生物信息分析指南 A guide to human microbiome research: study design, sample collection, and bioinformatics analysis Chinese Medical Journal DOI: https://doi.org/10.1097/CM9.0000000000000871 Review: 2020-6-26 钱旭波 1 , 陈同 2 , 徐益萍 1 , 陈雷 3 , 孙馥 ...
个人分类: 微生物组专著|6829 次阅读|没有评论
Protein Cell:扩增子和宏基因组数据分析实用指南
刘永鑫 2020-7-13 00:14
扩增子和宏基因组数据分析实用指南 A practical guide to amplicon and metagenomic analysis of microbiome data Protein Cell DOI: https://doi.org/10.1007/s13238-020-00724-8 Review: 2020-5-11 第一作者:刘永鑫 1,2,3 , 秦媛 1,2,3,4 , 陈同 5 通讯作者:刘永鑫(yxliu@genetics.ac.cn) 1,2,3 , ...
个人分类: 作者解读|8871 次阅读|没有评论
IBD:5-氨基水杨酸治疗后溃疡性结肠炎患者真菌菌群的变化
刘永鑫 2020-7-4 23:36
5-氨基水杨酸(5-ASA)治疗后UC患者真菌菌群的变化 Alteration of Fungal Microbiota After 5-ASA Treatment in UC Patients Inflammatory bowel disease 【 Impact Factor 4.261 】 DOI: https://doi.org/10.1093/ibd/izz207 发表日期:2020-03 第一作者:Xu Jun(徐俊) 1,2,3 通讯作者:Liu Yulan(刘玉兰 ...
个人分类: 读文献|2077 次阅读|没有评论
Microbiome:微生物群落在深海热液硫化烟囱体由活跃转换为非活跃状态过程中的演替模式
刘永鑫 2020-7-4 21:11
微生物群落在深海热液硫化烟囱体由活跃转换为非活跃状态过程中的演替模式 Microbial succession during the transition from active to inactive stages of deep-sea hydrothermal vent sulfide chimneys Microbiome DOI: https://doi.org/10.1186/s40168-020-00851-8 发表日期:2020-06-30 第一作者:Ji ...
个人分类: 读文献|3008 次阅读|没有评论
宏基因组微生物杂志简介及2020最新影响因子
刘永鑫 2020-6-30 05:52
2020年6月29日,2019年度的影响因子发布了,各种影响因子汇总的文章瞬间刷爆了朋友圈。 作为本领域的专业公众号,每年都会借此机会系统介绍一下本领域的杂志,为同行文献阅读、文章投稿的杂志选择、以及毕业升职加薪助力。 祝大家2020都能实现自己的一个小目标,集齐CNS或子刊! 后台回复 影响因子 ,获得2020最新完整 ...
个人分类: 新闻|13938 次阅读|没有评论
246.三元图在微生物组研究中的应用与绘图实战
刘永鑫 2020-6-29 00:04
三元图在微生物组研究中的应用 本节作者:吴一磊,中科院微生物所 版本1.0.5,更新日期:2020年6月28日 本项目永久地址: https://github.com/YongxinLiu/MicrobiomeStatPlot ,本节目录 246TernaryPlot,包含R markdown(*.Rmd)、Word(*.docx)文档、测试数据和结果图表,欢迎广大同行帮忙审核校对、并提修改意见。 ...
个人分类: 微生物组专著|12145 次阅读|没有评论
221.Beta多样性PCoA和NMDS排序
刘永鑫 2020-6-27 23:04
Beta多样性与PCoA和NMDS排序 本节作者:文涛,刘永鑫 版本1.0.4,更新日期:2020年6月27日 本项目永久地址: https://github.com/YongxinLiu/MicrobiomeStatPlot ,本节目录 221BetaPCoA,包含R markdown(*.Rmd)、Word(*.docx)文档、测试数据和结果图表,欢迎广大同行帮忙审核校对、并提修改意见。提交反馈的三种方 ...
个人分类: 微生物组专著|30958 次阅读|没有评论
BBI:在微生物组研究中使用宏转录组
刘永鑫 2020-6-27 19:53
在微生物组研究中使用宏转录组 Use of Metatranscriptomics in Microbiome Research https://doi.org/10.4137/BBI.S34610 Bioinformatics and Biology Insights 2016-04-20 Review Article DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkaa254 第一作者:Stavros Bashiardes 通讯作者: Eran Elinav(er ...
个人分类: 读文献|5743 次阅读|没有评论
NBT:PICRUSt2预测宏基因组功能
刘永鑫 2020-6-27 11:24
PICRUSt2预测宏基因组功能 PICRUSt2 for prediction of metagenome functions Nature Biotechnology 2020-06-01 Correspondence DOI: https://doi.org/10.1038/s41587-020-0548-6 第一作者:Gavin M. Douglas 1 通讯作者:Morgan G. I. Langille 1,7 (morgan.langille@dal.ca) 其他作者:Vince ...
个人分类: 读文献|12724 次阅读|没有评论

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