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置顶 · 薛良交-南京林业大学林学院
2019-11-6 20:06
http://linxue.njfu.edu.cn/sz/ShowJs.asp?id=358 http://linxue.njfu.edu.cn/info.php?cid=117 姓名: 薛良交 系别: 林木遗传育种系 职务: 教师 类别: 教授 最终学历: 博士研究生 最终学位: 理学博士 办公电话: 电子邮箱: lxue@njfu.edu.cn 教育经历: ...
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Two excellent tools for genomic data analysis
热度 1 薛良交 2014-4-18 20:34
https://github.com/tknijnen/msr/ Multiscale representation of genomic signals http://cran.r-project.org/web/packages/PopGenome/index.html A swiss army knife for population genetic genomic analysis
个人分类: Bioinformatics|3107 次阅读|2 个评论 热度 1
Tools to detect synteny blocks regions among multiple genome
薛良交 2014-3-10 06:36
Tools to detect synteny blocks regions among multiple genome Many tools are listed there: http://bioinformaticsonline.com/blog/view/4574/tools-to-detect-synteny-blocks-regions-among-multiple-genomes
个人分类: Bioinformatics|2490 次阅读|没有评论
Workshop on genome assembly and gene annotion
薛良交 2013-12-5 05:21
Workshop on genome assembly and gene annotion https://pods.iplantcollaborative.org/wiki/display/Events/2013+12+04+TSW+CSHL+Plant+Genomes+and+Biotechnology+Meeting When: Wednesday 4 December 2013, 12:00 PM - 05:00 PM Time Zone: (GMT-05:00) Eastern Time (US and Canada) https://cshl. ...
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定量生物学的未来
热度 1 薛良交 2013-7-30 01:43
最近在读 Growth of Biological thoughts,其中的一些论断在不同的地方也会遇到。但系统地组织在一起的还是第一遇到。 其中提到,物理学中主要是对定律进行发展,而生物学中主要是以概念的形式进行组织。 发展一个新的概念在生物学中也是很大的进步。 关于生物知识的系统化,书中提到: ...
个人分类: Bioinformatics|4574 次阅读|1 个评论 热度 1
BIG Data Analytics Pipeline
薛良交 2013-2-3 00:43
BIG Data Analytics Pipeline http://horicky.blogspot.com/2012/08/big-data-analytics.html
个人分类: Bioinformatics|3047 次阅读|没有评论
KEGG XML
薛良交 2013-2-1 05:22
http://www.biostars.org/p/1657/ Question: How to use the KEGG xml files? Three tools are mentioned there: KGMLreader KeggGraph http://kgml-ed.ipk-gatersleben.de/Introduction.html
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Two tools for Bisulfite sequencing
薛良交 2013-1-28 12:18
MethylCoder:Software Pipeline for Bisulfite-Treated Sequences BS Seeker: precise mapping for bisulfite sequencing BMC Bioinformatics, 11 (2010), p. 203
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如何制作发表质量的Venn(维恩)图
热度 7 薛良交 2011-6-27 00:07
如何制作发表质量的Venn(维恩)图
如何制作发表质量的Venn(维恩)图 --在Venn(维恩)图中根据数据比例调整集合的大小 通过不同方法,对于不同的研究对象,你可能得到不同的列表。比如不同表达模式的基因,不同 矿物的 组分,以及不同特征的人群......接下来,你可能希望把它们用集合的形式显示出来,看看各部分的交集,以及哪些 ...
个人分类: Bioinformatics|37270 次阅读|7 个评论 热度 7

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