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2012ISME:利用网络分析探讨土壤微生物群落共现模式
王敬敬 2020-7-22 13:42
Using network analysis to explore co-occurrence patterns in soil microbial communities 利用网络分析探讨土壤微生物群落共现模式 摘要 探索由高通量 DNA 测序技术产生的大型环境数据集需要新的分析方法,以超越对自然微生物群落组成和多样性的基本清单描述。为了研究微生物类群之间潜 ...
个人分类: 网络分析|4923 次阅读|没有评论
[转载]科学家绘制首个地球微生物共存网络
王敬敬 2020-7-1 14:02
作者:徐建明等 来源:《微生物组》 发布时间:2020/6/18 14:48:39 选择字号: 小 中 大 科学家绘制首个地球微生物共存网络 地球微生物组的互联特征 近日,浙江大学徐建明教授团队通过分析地球微生物组计划大数据,构建了全球微生物共存网络,通过对其“社会关系”的分析,首次揭示了地球 ...
个人分类: 网络分析|1153 次阅读|没有评论
微生物关联网络构建教程--Conet(2017年)
王敬敬 2020-6-5 14:40
Microbial association network construction tutorial 微生物关联网络构建教程 CoNet ( 2017 年) http://psbweb05.psb.ugent.be/conet/microbialnetworks/conet_new.php 这是 2014 年发布的 CoNet 教程的更新版本。 CoNet 提供了基于集成的网络构建,即 ...
个人分类: 网络分析|3126 次阅读|没有评论
综合利用igraph-Gephi-Cytoscape进行微生物群落的共现网络分析
王敬敬 2020-5-11 14:54
综合利用igraph-Gephi-Cytoscape进行微生物群落的共现网络分析 第一步:利用 R 软件中 igraph 包进行网络构建 https://blog.csdn.net/woodcorpse/article/details/78737867 # 安装需要的包,默认不安装,没安装过的请取消如下注释 install.p ...
个人分类: 网络分析|8736 次阅读|没有评论
2014 Environmental Microbiology: 全球污水处理厂活性污泥中细菌组装的分类相关性
王敬敬 2020-5-11 13:19
2014 Environmental Microbiology: Taxonomic relatedness shapes bacterial assembly inactivated sludge of globally distributed wastewatertreatment plants 2014 Environmental Microbiology: 全球污水处理厂活性污泥中细菌组装的分类相关性 https://sfamjournals.onli ...
个人分类: 网络分析|937 次阅读|没有评论

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