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农学统计| 杂谈| 随感| 翻译博客| 便捷操作| 文献解析| Python和Julia学习| R语言| 数量遗传学| 机器学习| GWAS|

表型相关与遗传相关及其显著性检验（数据及代码分享）: 邓飞 2016-7-31 17:13; 2018-10-09 修改备注: 1, 将代码修改, AAfun包不太好装, 使用VSNR包 2, VSNR包中有model.comp和asreml.lrt两个函数, 可以进行模型的比较和LRT检验 3, 代码correlation.R correlation.R 附件重新上传. 4, 贴上了我的最新的微信公众号表型相关与遗传相关及其显著性检验 ...; 个人分类: 农学统计|11757 次阅读|没有评论

R语言汇总统计，包括分组数据的汇总，结果友好（代码分享）: 邓飞 2016-7-5 09:00; 这个包不是必须，如果没有这个包，感兴趣的人可以下载数据来演示： oats.csv library(asreml) library(reshape) library(pastecs) data(oats) head(oats) 第一种，通用的描述性统计一般是没有分组的变量，比如产量，胸径等 stat.desc(oats$yield,norm=T) 第二种，手动定义函数，然后可以分组 ...; 个人分类: 农学统计|11992 次阅读|没有评论

ASReml-R多性状分析，怎么设置初始值？: 邓飞 2016-6-23 18:22; 建立了一个数据分析500人群，感兴趣的老师、同学添加微信号： joinVSNC 为好友，拉你进入数据分析群先进行单变量分析的原因： 1、确定显著性的因素（固定因素、随机因素），剔除不显著的 2、确定方差组分，为多变量分析时提供拟合初始值。设置初始值的目的： 1、容易拟合 2、快速拟合具体代码如下 ...; 个人分类: 农学统计|2871 次阅读|没有评论

SAS 处理裂区试验代码: 邓飞 2016-6-19 22:25; 建立了一个数据分析500人群，感兴趣的老师、同学添加微信号： joinVSNC 为好友，拉你进入数据分析群这里的数据是GenStat里面的Oats.ghs data split; input block$ w$ s$ v$ n$ y; cards; 1 1 1 Marvellous 0.6cwt 156 1 1 2 Marvellous 0.4cwt 118 1 1 3 Marvellous 0.2cwt 140 1 1 4 Marvellous 0cwt ...; 个人分类: 农学统计|2274 次阅读|没有评论

不同试验设计广义遗传率的分析: 邓飞 2016-6-19 22:06; 附件是不同试验设计广义遗传率分析的具体方法，包括随机区组、一年多点、多年多点怎么估算遗传率。有问题的可以给我留言，或者发送邮件到Dave@vsni.co.uk。农业试验中遗传率的计算方法.pdf; 个人分类: 农学统计|2857 次阅读|没有评论

excel 计算哈温平衡的卡方和相应的p值: 邓飞 2016-4-12 18:01; 对于田间试验和农业数据分析，请加入下面QQ群：VSNC GenStat 交流群 203276907 快速加入群，可以点击这个链接，里面有大量的资料可以下载和交流：点击链接加入群【VSNC GenStat 交流群】： https://jq.qq.com/?_wv=1027k=42XYzLq 用excel函数计算 1、先算出p值 2、根据p值和自由度，计算卡方值 ...; 个人分类: 农学统计|7156 次阅读|没有评论

联合方差分析的误差方差齐次性检测 R语言程序: 邓飞 2016-3-14 13:05; 对于田间试验和农业数据分析，请加入下面QQ群：VSNC GenStat 交流群 203276907 快速加入群，可以点击这个链接，里面有大量的资料可以下载和交流：点击链接加入群【VSNC GenStat 交流群】： https://jq.qq.com/?_wv=1027k=42XYzLq 联合方差分析，是用方差分析的方法。首先要考虑各地点见的误差同质性。 ...; 个人分类: 农学统计|4447 次阅读|没有评论

关于联合方差分析的讨论4-联合方差分析的实例演示: 邓飞 2016-3-9 15:44; 联合方差分析的示例：软件： GenStat 模型：方差分析模型和混合线性模型数据模型： y=u+b+x+y+xy+e 数据： 9 个品种在 10 地点的表现，观测值为产量数据，每个地点设置 4 个区组。数据如下： one-year-locations.xlsx 数据如下： A01 首先：查看误差方差的齐次性先看看第 ...; 个人分类: 农学统计|4325 次阅读|没有评论

关于联合方差分析的讨论3-联合方差分析的终结: 邓飞 2016-3-9 14:56; 如果地点间的误差方差不齐次，就没法进行联合方差分析，有两个解决措施： 1、加权联合方差分析 2、用误差方差异质模型分析加权联合方差分析：这种分析方法是补救方差不齐的联合方差分析方法，所谓方差不齐，就是在试验中，虽然设计相同，但试验的误差项方差并非实质相同，甚至相 ...; 个人分类: 农学统计|4028 次阅读|没有评论

关于联合方差分析的讨论-2-联合方差分析的计算方法: 邓飞 2016-3-9 14:48; 注：这里的公式，没法编辑，如果有需要，可以发我邮件：dengfei_2013@163.com。这里的计算方法主要是同质性检验（即：方差齐次性检验），联合方差分析中的同质性检验不是方差的检验，而是误差的检验，下面会有解释。同一个地点的误差同质性检测，虽然也是用 bartlet ...; 个人分类: 农学统计|10386 次阅读|没有评论

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