科学网—niuneat的博文

置顶 · 升级版|16srRNA微生物多样性测序报告解读

2021-4-1 17:29

微生物多样性测序（扩增子测序）是基于二代高通量测序对16S/18S/ITS等序列进行测序。可以同时检测样本中的优势物种、稀有物种及一些未知物种的检测，获得样本的微生物群落组成以及相对丰度。相信关注我们的小伙伴对此并不陌生。这次我们整合了大家平时会遇到的一些问题，在原有的基础上对报告进一步完善。 ...

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置顶 · [转载]多快好省的宏基因组研究技巧 — 资深专家分享

2020-4-27 13:34

谷禾健康原创近年的研究热点集中于环境和生物体相互作用的微生物群体，而大量复杂的微生物群体存在培养困难，构成复杂（包括细菌、古菌、真菌、原生生物、病毒甚至小型真核生物）。因此如何用高通量精准的了解这些群体的构成，基因功能分布以及具体的表达活性和代谢状况成为首要问题。高通量测序技术 ...

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置顶 · [转载]微生物多样性测序结果如何看？

隐藏 2019-11-18 14:37

原文如何读懂和利用你的微生物多样性测序结果？谷禾健康原创做过16s测序的小伙伴们都知道测完之后会拿到一份结果报告但这并不代表可以开始写文章了看似一大堆数据图表却不知如何下手这是很多人头疼的地方那么怎样给报告中的数据赋予灵魂让它真正成为对你有帮助的分析呢？今天我们来详细解 ...

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[转载]TaxiBGC ——分类学指导下的生物合成基因簇鉴定流程

牛耀芳 2022-12-5 21:46

当前合成基因簇预测限制较大微生物基因组中的生物合成基因簇 (BGC) 编码具有生物活性的次级代谢物 (SM)，它可以在微生物-微生物和宿主-微生物相互作用中发挥重要作用。鉴于次级代谢物的生物学意义和当前对微生物组代谢功能的深刻兴趣，从高通量宏基因组数据中无偏见地鉴定生物合成基因簇可以 ...

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[转载]用于CAZyme研究领域的数据库——dbCAN-seq数据库更新

牛耀芳 2022-12-5 21:40

什么是CAZymes？ CAZymes （碳水化合物活性EnZymes）是一种酶，主要以糖苷键为目标，降解、合成或修饰地球上的所有碳水化合物。CAZymes在植物和植物相关微生物中非常丰富。例如，人体肠道是富含碳水化合物的环境，碳水化合物降解细菌的多样性非常高。肠道微生物组的CAZyme组合组成了数以万计的附加 ...

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[转载]肠道微生物群在过敏性鼻炎中的作用

牛耀芳 2022-11-23 12:52

过敏性鼻炎是个全球性健康问题，易反复发作，困扰着全世界大约着4亿人。自20世纪60年代以来，过敏性鼻炎的患病率持续上升。近几年，我国主要大中城市过敏性鼻炎的平均患病率从11.1%升高到17.6%。过敏性鼻炎主要临床表现包括发痒、打喷嚏、鼻塞等，这些症状不加以改善，严重的话会导致睡眠障碍、学习 ...

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[转载]猫狗肠道菌群—“主子们”的健康新领域

牛耀芳 2022-11-16 11:00

随着生活水平提升，我国养宠人士逐年增多。数据显示，我国城镇养宠人士达到 6844万多人，且仍在不断增长。其中养猫人群数占比59.5%，养狗人群数占比51.7%，养水族类占比8.3%，养爬行类宠物的占比为5.8%；啮齿类占比4.5%；鸟类占比3.6%。养宠物，它们的健康绝对是重要的一方面。同时宠物的健康在一定程度 ...

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[转载]性早熟和微生物群：性激素-肠道菌群轴的作用

牛耀芳 2022-11-14 10:14

肠道菌群性激素青春期是生命的一个关键阶段，与性成熟相关的生理变化有关，是一个受多种内分泌和遗传控制调控的复杂过程。青春期发育可以在适当的时候，早熟或延迟。未经治疗的性早熟的孩子通常不会达到成年身高的全部潜力。性早熟的女孩可能会因为比同龄人早来月经或乳房增大 ...

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[转载]肠道微生物在天然产物生物转化中的潜在作用

牛耀芳 2022-11-4 16:34

什么是天然产物？天然产物是指动物、植物、昆虫或微生物体内的组成成分或其代谢产物以及人和动物体内许多内源性的化学成分，是自然产生的小分子。值得注意的是，天然产物来源中，植物来源占 85% 以上。谷禾在这里主要介绍植物来源的天然产物，包括营养素和药物。它们很容易与肠道微生物 ...

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[转载]全面解析各类营养物质在炎症中的作用

牛耀芳 2022-10-25 11:32

日常感觉疲劳，精力不好，稍微不注意就容易腹泻便秘，一不小心就感冒，更可怕的是，无论使尽各种方法依然减不下去的体重 ...... 有以上状况的小伙伴注意，可能是慢性炎症在体内作怪。炎症是我们免疫系统的自然反应，也就是说身体和病原体斗争，试图自愈的过程。根据时间和病理特征，炎症可以是 ...

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[转载]肠道菌群失调与炎症性肠病的关联

牛耀芳 2022-10-24 11:21

健康是人生命活动的根本，而肠道健康更是其中的重要部分。随着现代生活方式改变，炎症性肠病发病率增加。炎症性肠病是一种严重影响患者生活质量的疾病。在全球范围内影响数百万人，发病率高，给卫生保健系统带来了沉重负担。 ●炎症性肠病的病因炎症性肠病的病因尚不明确，可能与肠道免疫反应异 ...

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[转载]Pantoea(泛菌属)——肠道内善恶兼备的神秘细菌

牛耀芳 2022-10-19 17:27

Pantoea （泛菌属）：是肠杆菌科内一个高度多样化和多变的菌属，也是肠道内神秘的“善恶兼备” 的细菌。 ▸直到最近，人们对 Pantoea 还是一个模棱两可的认知。用研究人员的话来说： “这些物种既是植物，动物，人类的机会病原体，又能生产在除草剂，重金属螯合剂，抗生素等方面发挥着非常关键的 ...

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[转载]如何理解报告中有害菌，病原菌，致病菌？

牛耀芳 2022-10-18 11:32

大多数细菌对我们的生活是有帮助和必要的，某些细菌可以帮助消化，为身体提供能量，分解毒素，保护肠道，增强免疫力等，从而有益健康；也有一些细菌会给我们的健康带来一些危害。然而有些菌并不是天生注定就是致病菌，也许正常状况下，它只是体内默默地存在着，但可能在某种特定条件下突然变身，彰显其致病 ...

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