科学网—niuneat的博文

置顶 · 升级版|16srRNA微生物多样性测序报告解读

2021-4-1 17:29

微生物多样性测序（扩增子测序）是基于二代高通量测序对16S/18S/ITS等序列进行测序。可以同时检测样本中的优势物种、稀有物种及一些未知物种的检测，获得样本的微生物群落组成以及相对丰度。相信关注我们的小伙伴对此并不陌生。这次我们整合了大家平时会遇到的一些问题，在原有的基础上对报告进一步完善。 ...

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置顶 · [转载]多快好省的宏基因组研究技巧 — 资深专家分享

2020-4-27 13:34

谷禾健康原创近年的研究热点集中于环境和生物体相互作用的微生物群体，而大量复杂的微生物群体存在培养困难，构成复杂（包括细菌、古菌、真菌、原生生物、病毒甚至小型真核生物）。因此如何用高通量精准的了解这些群体的构成，基因功能分布以及具体的表达活性和代谢状况成为首要问题。高通量测序技术 ...

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置顶 · [转载]微生物多样性测序结果如何看？

隐藏 2019-11-18 14:37

原文如何读懂和利用你的微生物多样性测序结果？谷禾健康原创做过16s测序的小伙伴们都知道测完之后会拿到一份结果报告但这并不代表可以开始写文章了看似一大堆数据图表却不知如何下手这是很多人头疼的地方那么怎样给报告中的数据赋予灵魂让它真正成为对你有帮助的分析呢？今天我们来详细解 ...

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[转载]时间本身成为一种资源，微生物可以利用它进入新的栖息地

牛耀芳 2020-10-22 15:51

谷禾健康微生物需要能源和细胞构成的材料。他们还需要使用液态水来达到自然条件，并且细胞损伤率要低于修复。当缺乏资源和自然条件时，微生物通常会进入某种形式的休眠状态（例如，通过停止细胞分裂，减慢新陈代谢速度或形成内生孢子），直到它们再次生长。例如，在晚上，营养养分等待太阳回来。在冬季，土壤微生物 ...

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[转载]细菌拮抗作用在细菌生活中的核心作用

牛耀芳 2020-10-20 14:53

谷禾健康大多数细菌可能存在或至少有一部分时间处于单细胞状态。在这种单细胞状态下，细菌将更容易受到一系列威胁，包括其周围环境的物理或化学性质的简单波动，更容易受到更直接的生物威胁，如抗生素、噬菌体、拮抗细菌，甚至是捕食性单细胞真核生物。因此，每一个细菌细胞都必须具备应对这种威胁的能力，微米尺 ...

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[转载]城市化减少了空气中微生物，这对我们的健康意味着什么？

牛耀芳 2020-10-12 12:01

背景目前，全球一半以上的人口居住在城市，到2050年，这一比例预计将增加到70％。城市为人类带来了各种好处（例如，更大的就业，教育机会以及接触多种文化和食物的机会），但会影响我们与自然的互动。重要的是，空气质量，建筑物密度，植被和运输路线等城市特征可能会影响健康，部分原因是改变了环境微生物群落（ ...

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[转载]微生物群对三大过敏性疾病发展的影响

牛耀芳 2020-10-9 10:24

在前一篇文章生命早期微生物接触和过敏风险：如何预防，我们已经了解了微生物与过敏之间千丝万缕的联系。从构建微生物开始，到影响微生物的因素，过敏机制的阐述以及预防过敏的措施等都有了基本的认识。本文将对微生物在过敏性疾病（食物过敏、特异性皮炎、哮喘）中的作用进行逐一介绍，尤其是微生物在儿童食 ...

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[转载]宏观生态规律如何应用于描述微生物群落的多样性和变化

牛耀芳 2020-9-28 11:35

宏观生态学中研究最多的模式是物种分度分布(SAD)，它被定义为具有给定丰度的物种的比例。研究中虽然对SAD进行了高度的研究和表征，但往往忽略了三个不同而独立的变异源对其的影响:采样噪声、个体物种丰度的波动和物种间丰度的变化。最近，发表在《Nature Communications》的一篇文章使用来自许多不同环境的微生物群落的纵 ...

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[转载]Science|慢性肾病与肠道菌群新机制

牛耀芳 2020-9-23 11:24

谷禾健康肾脏的主要功能是保持体内平衡，包括酸碱平衡，水平衡，血压调节和葡萄糖稳态在内的功能需要肾脏进行精确的协调和调节。全球大约9％的人口正在遭受慢性肾脏疾病。近年来，研究表明，肠道菌群的变化（通常是各种细菌的相对比例的变化）与多种疾病和病症相关，包括肥胖，糖尿病，躁郁症和抑郁症，人们 ...

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[转载]最新研究《Cell》纵向多组学揭示肠易激综合征（IBS）的潜在机制

牛耀芳 2020-9-18 13:26

谷禾健康肠道微生物组与多种人类慢性胃肠道（GI）疾病有关。肠易激综合症（IBS）是一种普遍存在的疾病，其特征是反复出现腹痛或不适。IBS主要见于女性，并与粪便形式或频率变化有关，并基于主要便秘形式（便秘为主（IBS-C），腹泻为主（IBS-D）或混合型（IBS-M））。由于动物和人类研究之间明显的脱节以及缺乏针对疾病 ...

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大样本人群揭示肠道菌群与血压之间的关系

牛耀芳 2020-9-7 15:32

谷禾健康最近，欧洲心脏病学杂志《European Heart Journal》发表了荷兰由阿姆斯特丹大学研究的最新成果：“Associations between gutmicrobiota,faecal short-chain fatty acids, and blood pressure across ethnic groups: the HELIUS study（不同民族群体间肠道菌群、粪便短链脂肪酸和血压之间的关系）”，这是首个 ...

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最新研究进展|肠道微生物组在改善抗癌治疗效果方面的强大作用

牛耀芳 2020-9-4 15:43

世界卫生组织（WHO）已将癌症确立为一种全球威胁，每年夺去大量生命。仅在2018年，它就造成960万人死亡，是全球第二大死亡原因。癌症仍然是主要的健康灾难。最近的研究已指出人类共生肠道微生物群参与调节化学疗法和免疫疗法的结果。它主要是通过调节药物的代谢和宿主免疫反应来实现的。癌症的治疗方式探索 ...

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肠道微生物群与不健康衰老

牛耀芳 2020-8-24 18:06

每个人都想长生不老，但没有人想变老。我们渴望长寿，但是对衰老又非常恐惧。研究发现长寿者和体弱者的微生物群之间存在着深刻的差异，与年龄相关的微生物失调会导致肠道通透性、全身炎症和过早死亡，但这些差异在多大程度上促进或阻止了晚年的健康尚不清楚。肠道微生物群随着年龄的增长而变化，但目前尚不清楚这些变化在 ...

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