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【bio】颤抖吧!数学来了!支原体数学模型从基因型预测表型
严云 2012-7-20 11:12
从CELL封面2012年7月20日图来看: 左上密码子表(确定无误) 右上FBA (确定无误) 左中名词解释 (确定无误) 右中是状态机 左下随机过程马尔可夫过程(四种RNA聚合酶结合状态) 右下mRNA降解/生成动态平衡(以基因预测?)
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【乱扯】单细胞水平研究确实靠谱!
热度 1 严云 2012-2-15 13:49
早些时候本人自己乱想了些问题( 如何确定基因敲除是在对所有细胞都管用?还是只是概率事件? ) 发现这些问题也确实有人也在想,并且确实发表了相关文章。 以2012年2月出现的一篇 在Molecular Cell上发表的《Single-Cell Analysis Reveals that Noncoding RNAs Contribute to Clonal Heterogeneity by Modulating ...
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如何确定基因敲除是在对所有细胞都管用?还是只是概率事件?
热度 3 严云 2011-11-17 01:39
如何确定基因敲除是在对所有细胞都管用?还是只是概率事件?
【引子】 最近在思考本人课题(其实一直在思考),拨开课题特例本身,牵扯到一个小问题,而这个问题我个人感觉是有普遍性地(虽然对于一般的基因工程而言多余的)。基因下调,效果究竟是作用在一个细胞而言还是一群细胞而言的。 --- 简单而言,RNA splicing里有个有趣的设计, ...
11898 次阅读|6 个评论 热度 3
【bio】“吸血鬼”细菌——“我是活着的战士”
严云 2011-11-2 03:06
今天一边目睹了google reader的恶心UI变化,同时也发现了一个挺好玩的研究—— “吸血鬼”细菌 【 1 】。当看见Pseudomonas aeruginosa(绿脓假单胞菌)时本人眼前一亮,而当antibotic、disease、lung infection等字眼同时出现时,我知道,这又是一项“舒肤佳杀菌、保护人类健康”的研究。所针对的敌人 ...
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生物计算机
热度 1 严云 2011-10-21 02:34
生物计算机
一切源自于这篇paper,我表示我看过了abstract之后觉得这其实挺简单的。(对于这篇文章我个人的欣赏容我把原理和吐槽说完再写) 但是几天之后 生物谷等开始给于评论 说:英国研究人员最近用细菌和基因手段开发出一种可模块化的新型“生物逻辑门”, 为研制生物计算机铺平道路。 我不知道这是哪家 ...
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