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从"本手、妙手、俗手"的角度谈谈生物信息
陈成 2022-6-7 16:43
关于生物信息我的拙见:本手是学好遗传学,数理统计学,熟悉各类数据库,文件结构,掌握一门编程语言如python。妙手是掌握各类算法,会使用多种编程语言如Perl,R,C/C++, Java等,以满足不同的使用场景。同时,读写能力强,可无障碍阅读各类英文资料。俗手是只会在线blast...
个人分类: 生物信息学|908 次阅读|没有评论
面向对象与递归实现DNA序列反向互补(二)
陈成 2022-5-7 10:28
序列反向和反向互补是进行生物信息分析的常见做法。为了实现序列的反向和者反向互补,可以采用不同的方法。这里使用python语言,采用面向对象编程的for...loop结构和面向对象编程的递归(recursion)实现序列的反向与反向互补。关于面向对象编程( Best Practices of ...
个人分类: 生物信息学|834 次阅读|没有评论
面向对象与递归实现DNA序列反向互补
陈成 2022-5-4 16:10
序列反向和反向互补是进行生物信息分析的常见做法。为了实现序列的反向和者反向互补,可以采用不同的方法。这里使用python语言,采用普通的for...loop结构和递归(recursion)实现序列的反向与反向互补。关于面向对象编程( Best Practices of Object Oriented Programming (OOP) - GeeksforG ...
个人分类: 生物信息学|932 次阅读|没有评论
【Science】重大突破!小麦产量性状新基因被发现
陈成 2022-4-8 13:49
恭喜我的导师贾海燕老师的研究成果在Science上发表,多年的积淀和辛勤付出,终得回报。通过图位克隆的方法,分离得到的TaCOL-B5基因,能够显著提高小麦产量。成果喜人,应用前景广阔。真是鼓舞人心,令人激动的杰作。纵观Liuling Yan教授所发表的一些文章,可以看出,其很多经典的工作(PNAS,200 ...
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Zotero使用说明
陈成 2017-12-10 23:50
2017-12-10 一、简介: zotero是开源的文献管理工具,可以方便的收集,组织,引用,和共享文献的工具。由安德鲁·w·梅隆基金会,斯隆基金会以及美国博物馆和图书馆服务协会资助开发。支持Windows,MacOS,及Linux操作系统。 二、下载网站: Zotero可在( https://www.zotero.org/download/ )上进行下载,如 ...
6224 次阅读|1 个评论
perl根据列合并多个文件(不超过5个)
陈成 2017-12-6 15:24
#!/usr/bin/perl -w use strict; #=============================================================# # Function: This script is used to combine files (not more than 5) together according # # their columns for the snp variant type . &nb ...
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get_LOD_peak.pl(MapQTL6.0)
陈成 2017-3-9 15:19
#!/usr/bin/perl -w #=============================================================== # This script is used to extract the LOD value of a batch of files at 95% informative interval for MapQTL # By chencheng hengbenxianfeng@163.com # Start time: 2017/3/6 19:40 # End time: 2017/3/6 20:10 # Title ...
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get_GC_N50_N90.pl
热度 1 陈成 2017-3-3 16:15
#!/usr/bin/perl -w use strict; # This script is used to calculate the Scafford length,GC content,N50,N90, and reference length,reference GC content of # a species's genome,which has a fasta format. #================================================================================= # by Chen ...
3339 次阅读|6 个评论 热度 1

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GMT+8, 2022-10-6 09:36

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