|
一、看不见的污染
支原体是细胞培养中最隐蔽的"常客"。它没有细胞壁,直径仅0.3微米左右,能穿过0.22微米除菌滤膜;作用于细胞壁的抗生素(如青霉素)对它天然无效——常规除菌和抗生素防线,恰恰对支原体形同虚设。它污染培养物后不产生浑浊、不改变pH、也不会让细胞死亡,显微镜下一切正常,肉眼根本没有信号。等你发现实验数据异常时,污染往往早已存在。那么,支原体到底有多普遍?
二、源头追踪
污染究竟从哪来?美国国家转化科学促进中心(NCATS)2020年公布的一组质控数据很有说服力:他们对进库细胞系做常规支原体检测,初始筛查就发现超过10%的样本被污染。研究者还注意到一个关键线索——只有培养过的细胞被污染,原代组织样本几乎不受影响,这强烈指向操作环节而非试剂本身。支原体最著名的扩散途径之一正是实验室人员:它们可寄居在人体的口腔和呼吸道,通过说话、呼吸、飞沫进入培养体系。文章因此直言:连续培养细胞中支原体的首要来源,被认为来自实验人员自身。此外,污染谱系也十分集中——M. orale(口腔支原体)、M. hyorhinis(猪鼻支原体)、M. arginini(精氨酸支原体)、A. laidlawii(莱氏无胆甾原体)等常见物种,就占了污染细胞系的90%-95%;其中A. laidlawii自上世纪70年代起就被认为与牛血清污染相关。可见,源头主要藏在你我身上,也藏在血清等试剂里。
三、被污染的,不止你的细胞,还有你参考的数据
支原体污染的影响,远超你手头的培养皿。2015年,美国团队Olarerin-George和Hogenesch在Nucleic Acids Research发表了一项研究:他们分析NCBI序列读取归档(SRA)中9395个啮齿类和灵长类样本、884个系列的高通量测序数据,以"每百万reads中至少100条映射到支原体"为污染阈值,发现11%的系列被污染;把阈值放宽到每百万reads 10条,污染率更接近15%。更耐人寻味的是,这些支原体reads中有90%来自核糖体RNA——即便37%的污染系列采用的是poly(A)富集(理论上能滤掉rRNA的建库方式),依然没能躲过支原体。文献中历年报告的污染率,也从15%到70%不等。这意味着:你检索到的不少公共数据,乃至你参考的一些文献结果,可能正建立在被支原体污染的细胞之上。
四、防住源头,定期筛查才是底线
既然污染防不胜防、又常从人和试剂而来,防线自然要"关口前移"。其一,源头管控:使用经过检测认证的血清,规范人员操作(戴口罩、避免飞沫),液氮罐、水浴等共用设备注意交叉污染。其二,常规筛查:污染在微量时就能悄悄改写基因表达与代谢,肉眼不可见,必须依赖定期检测。其三,检测手段要可靠:qPCR当天出结果、灵敏度达10 CFU/mL、覆盖常见物种、内置内控避免假阴性。"定期筛查+源头管理"双管齐下,才可能把支原体挡在实验数据之外。
翼和生物支原体qPCR检测试剂盒,采用TaqMan探针法多重荧光定量PCR,覆盖120种支原体,灵敏度可达10 CFU/mL,适配主流qPCR仪,适用于免疫学实验室、细胞治疗研发及生物制品生产的支原体污染常规监测。
参考文献:
1. Olarerin-George AO, Hogenesch JB. Assessing the prevalence of mycoplasma contamination in cell culture via a survey of NCBI's RNA-seq archive. Nucleic Acids Res. 2015 Mar 11;43(5):2535-42. doi: 10.1093/nar/gkv136.
2. Roth JS, Lee TD, Cheff DM, Gosztyla ML, Asawa RR, Danchik C, et al. Keeping It Clean: The Cell Culture Quality Control Experience at the National Center for Advancing Translational Sciences. SLAS Discov. 2020 Jun;25(5):491-497. doi: 10.1177/2472555220911451.
3. Drexler HG, Uphoff CC. Mycoplasma contamination of cell cultures: Incidence, sources, effects, detection, elimination, prevention. Cytotechnology. 2002 Jul;39(2):75-90. doi: 10.1023/A:1022913015916.
Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )
GMT+8, 2026-9-3 16:46
Powered by ScienceNet.cn
Copyright © 2007- 中国科学报社