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跳出农田造蛋白:体外模块化酶级联实现甲醇合成多种氨基酸

已有 67 次阅读 2026-8-26 16:03 |个人分类:分享|系统分类:科研笔记

氨基酸是构成蛋白质的基本结构单元,广泛应用于食品添加剂、营养制剂、饲料加工及生物医药等诸多领域。当前工业氨基酸生产以微生物发酵工艺为绝对主流,生产原料高度依赖大豆、玉米、淀粉等农业生物质资源。该传统工艺技术成熟、适配量产,但存在显著的资源与环境短板:生产过程消耗大量耕地、淡水资源,易引发粮饲争地问题,且整体碳排放强度较高,产业可持续发展面临明显瓶颈。在“双碳”目标引领与绿色生物制造产业快速迭代的背景下,摆脱农作物原料依赖、依托一碳原料人工生物合成氨基酸,已成为合成生物学与碳资源化利用领域极具产业化潜力的核心攻关方向。

慕尼黑工业大学Volker Sieber教授团队长期深耕无细胞一碳生物催化技术,近年来实现了从单一氨基酸合成到多品类氨基酸模块化合成平台的阶梯式技术突破,为非粮化、低碳化制备蛋白基原料开辟了全新技术路径,系列标志性研究成果相继刊发于《Chem Catalysis》与《Nature Communications》等国际权威期刊。

团队2023年的奠基性研究,首次构建了辅因子自平衡的无细胞纯酶催化体系。该研究以二氧化碳资源化转化制备的绿色甲醇为唯一碳源,在体外无细胞体系中高效合成L‑丙氨酸,明确验证了纯酶体系依托一碳底物合成氨基酸的技术可行性。相较于活体微生物发酵,该体系彻底规避了细胞内源代谢冗余、代谢调控受限等固有缺陷,成功打通“甲醇—氨基酸”体外生物合成的核心技术链路,为后续多品类、多结构氨基酸模块化合成体系的搭建筑牢了技术根基。

在上述奠基性工作的基础上,该团队在2026年发表于《Nature Communications》的最新研究实现了关键技术迭代。研究核心目标是搭建一套高灵活性、可拓展的酶催化平台,验证单一碳源甲醇合成多类型氨基酸的可行性。团队成功搭建即插即用的模块化酶级联催化系统,依托数据库筛选、逆向工程设计思路,从不同物种中筛选适配性酶元件,人工组装出自然界不存在的非天然代谢通路,稳定合成甘氨酸、丝氨酸、L‑天冬氨酸、L‑缬氨酸、L‑谷氨酸、L‑脯氨酸六种碳链长度、结构复杂度各异的氨基酸,完成多品类氨基酸一碳合成的系统性概念验证。该成果大幅拓宽了甲醇生物高值转化的产物谱系,突破了传统一碳生物催化产物单一、通用性差的技术局限。

整套无细胞酶级联体系采用标准化三级模块化设计,分工明确、逻辑严密、拓展性极强,完全适配人工定向调控需求。第一模块为碳骨架重构单元,核心功能是将单碳甲醇精准转化为二碳前体乙醇醛、三碳前体二羟丙酮;通过调控初始阶段关键酶的种类与配比,可精准控制两种前体物质的生成比例,从源头定向决定下游可合成的氨基酸品类。第二模块为中间代谢与辅因子再生单元,在生成各类代谢中间体的同时,同步完成关键辅酶的再生循环,在保障反应高效推进的同时,大幅降低外源辅因子的添加成本。第三模块为终产物合成单元,依托前述碳骨架前体与原位再生辅因子,通过多级酶促反应完成氨基修饰、碳链重构,最终定向合成目标氨基酸。为规避甲醇及其中间代谢产物对活体微生物的毒性抑制,团队全程采用无细胞游离酶级联体系,彻底摆脱活细胞的生存代谢约束。

相较于传统微生物细胞工厂,本研究采用的游离酶无细胞催化体系具备多重独特技术优势。甲醇及其代谢中间产物对微生物菌体具有明显细胞毒性,会抑制菌体活性、限制底物加载浓度与反应效率,是活体发酵体系一碳转化的核心瓶颈;而无细胞纯酶体系无需维持细胞生长、增殖与内源代谢平衡,彻底规避了菌体毒性耐受上限、内源代谢竞争、细胞膜物质转运限制等固有问题。同时,该体系可实现跨物种功能酶元件的自由筛选与精准组装,打破了自然界固有代谢通路的保守性限制,极大提升了人工生物合成通路的设计自由度与改造空间。

批量实验结果显示,该模块化体系的催化效能与氨基酸结构复杂度直接相关,产物转化率呈现明显差异化特征。其中结构最简单的甘氨酸转化效率最优,底物转化率高达91%;而结构复杂的L‑谷氨酸转化率仅为46%,复杂氨基酸的催化效率与体系适配性仍有显著优化空间。对此,研究团队明确表示,后续将聚焦体系优化,通过酶蛋白定向改造、反应参数精细化调优、通路配比动态优化等多种方式,持续提升整套系统的通用性、稳定性与产物整体收率。相较于迭代数十年的传统发酵微生物改造,团队核心负责人Sieber指出,单一酶元件的定向工程改造效率更高、迭代速度更快,体系优化潜力远优于完整微生物底盘改造。

SpheriTech生物技术公司创始人、行业资深专家Donald Wellings以独立评审视角,对该创新体系给予高度评价,认为整套设计思路极具前瞻性与创新性。他同时结合产业落地场景,客观指出两大核心工程化难题。第一,游离酶悬浮反应体系中,功能酶与氨基酸产物共存于反应液,导致下游产物分离、提纯难度大幅增加,纯化成本偏高,后续可通过酶固定化技术,实现酶的固载复用,简化工艺流程、降低纯化成本。第二,该级联通路中使用的多种特色酶元件,目前尚无商业化量产工艺,酶制剂的规模化、低成本生产,是该技术实现工业化放大的核心前置条件。总体而言,Wellings认为该技术路线方向正确,具备极佳的未来产业化潜力。

从产业全局视角客观研判,当前全球氨基酸供给充足,传统发酵工艺凭借数十年技术积累,具备成本低、产能大、工艺稳定的绝对优势,该无细胞酶级联合成体系短期内尚不具备替代主流发酵工艺的条件。但该研究的核心价值不在于短期产能替代,而是突破了氨基酸合成高度依赖农业种植的产业桎梏,成功构建“二氧化碳—绿色甲醇—氨基酸”的负碳合成新链路。依托绿电碳捕集技术,可将温室气体二氧化碳转化为甲醇底物,再通过人工酶体系合成蛋白原料,实现温室废气的高值化闭环利用,为缓解耕地、水资源压力,降低生物制造产业碳排放提供了全新的可持续发展方案。

从学科发展维度分析,该研究为一碳生物制造领域提供了可复制、可拓展的全新研发范式。传统碳生物转化研究高度依赖工程菌底盘,始终受限于细胞膜转运屏障、内源代谢通路竞争、毒物耐受能力有限、代谢调控复杂等天然短板;而模块化无细胞酶体系以“标准化、可组装、可替换、可定制”为核心特征,彻底打破了自然生物代谢的固有局限,为精细化学品、功能营养原料、高端生物基材料的定制化绿色合成提供了全新研发思路。

综上,该系列研究系统验证了甲醇经模块化酶级联反应合成多品类氨基酸的科学性与可行性,创新突破了传统农业依赖型蛋白原料制造模式,构建了非粮化、低碳化的生物合成新路径。目前该技术在核心酶稳定性、酶制剂量产成本、复杂氨基酸产物收率、工业化分离纯化工艺等工程化应用维度仍需持续攻关优化。但整体而言,该成果有效突破了传统生物制造的资源与环境约束,为低碳可持续生物制造产业的技术迭代提供了重要参考,也为国内无细胞催化技术研发、一碳资源高值化利用领域的科研布局与产业落地提供了有益借鉴。

参考文献

[1] Willers, V. P., Döring, M., Beer, B., & Sieber, V. (2023). Cell‑free enzymatic L‑alanine synthesis from green methanol. Chem Catalysis, 3(3), Article 100502. https://doi.org/10.1016/j.checat.2022.100502

[2] Willers, V. P., Lehmann, V., Müller, S., Vogelgsang, F., Roth, A., Blombach, B., Pick, A., & Sieber, V. (2026). Plug‑and‑play – enzymatic amino acid production from methanol and carbon dioxide. Nature Communications, 17(1), 5363. https://doi.org/10.1038/s41467-026-74522-x

[3] Bradford, S. (2026, August 21). An enzymatic modular system makes amino acids from methanol. The Scientist. https://www.the‑scientist.com/an‑enzymatic‑modular‑system‑makes‑amino‑acids‑from‑methanol‑74903

 




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