好的，这是一个在临床诊断和微生物研究领域非常关键的主题。宏基因组下一代测序（mNGS）与靶向下一代测序（tNGS）是两种用于病原体检测的强大技术，它们的设计思路、应用场景和优缺点各有不同。 下面我将对它们进行详细的比较和解释。

如何选择？一个临床决策视角

这两种技术不是相互替代，而是互补关系。

选择 mNGS 当：

患者病情危重、复杂，传统方法无法明确病因。

怀疑是新发、突发或罕见病原体感染。

患者有免疫缺陷，可能感染不典型病原体。

作为终极诊断工具，在常规检测阴性后使用。

选择 tNGS 当：

怀疑是一组明确的常见病原体引起的感染（如社区获得性肺炎的常见病原体panel）。

需要快速、高灵敏度地排除或确认特定感染（如结核性脑膜炎）。

不仅想鉴定病原体，还希望同时获得耐药信息以指导抗生素使用。

希望在保证性能的同时，控制成本和缩短报告时间。

未来的发展趋势是两者融合，例如先使用mNGS进行广谱筛查，再针对检出的可疑病原体使用tNGS进行深度测序以验证和获取耐药信息，从而实现更精准、全面的感染病诊断。

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