Circos的安装技巧 (Mac OS) 2017-09-03

Circos是一个基于Perl写的应用非常广泛的基因组圈图绘制软件。生信技能树给出了比较简要的使用说明：http://www.biotrainee.com/thread-753-1-1.html。 当然软 ...

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Conda - 多平台软件管理平台 2017-07-04

在做生物计算时，往往需要安装很多软件包，例如目前比较流行的python包。但是很多时候不同软件存在dependence,安装起来较为繁琐。 Conda是一个可用于多平台(Wi ...

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使用Aspera高速下载SRA/ENA测序数据 2016-12-27

在做基因组学数据分析，往往需要从NCBI/sra 或者EBI/ENA下载高通量的测序数据。通常的ftp下载(或者wget)，或者sratoolkit下载往往耗时太长，这时一种大数据下载 ...

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非root用户在linux服务器安装python package 2015-06-03

最近科研分析用到一个python 程序， CPAT (coding potential assessment tool), 需要在服务器上运行。由于该程序基于python 2.7(且仅基于)，而服务器默认安装的 ...

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使用 Perl API 获取KEGG数据 2014-11-03

背景介绍：    1. 自2012年7月，KEGG不再免费提供FTP下载数据服务，用户需要付费获取一定时间的数据FTP下载服务 （~$2000/year）。这对批量下载K ...

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Cygwin - Windows下的Linux模拟器 2014-09-25

    习惯于在Linux下工作的同学，换到Windows下后有时总想实现Linux下的很多功能，这个时候一个好的Linux模拟器就必不可少了（当然若只是想实现在Wi ...

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