NCBI Assembly数据库使用指南：轻松下载组装基因组 2025-11-04

在微生物组学与病原生物学研究飞速发展的今天，获取高质量的细菌基因组数据是每一项重要发现的起点。无论是溯源分析、比较基因组学、疫苗设计还是耐药性研究， ...

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肺炎克雷伯菌的分型和克隆传播 2025-09-24

第一部分：肺炎克雷伯菌的分子分型 1.1 多位点序列分型（ MLST ） MLST 是一种重要的分子分型技术，常用于研究病原微生物的种群动态、传播规律 ...

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细菌基因组注释 | 第二站：高精度注释工具Bakta 2025-09-18

在之前的文章中，我们介绍了原核基因组自动注释工具 Prokka 的使用方法。本节我们将继续介绍另一款注释工具——Bakta。 Bakta（Bacterial Genome Annotation T ...

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大肠埃希菌的分型和克隆传播 2025-09-15

第一部分：大肠埃希菌的流行病学分型 1.1 系统发育分型（ Phylogroup ） 大肠埃希菌（ Escherichia coli ）通常使用 phylogroup （称为亚特 ...

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实用组学小工具——耐药基因注释（CARD-RGI） 2025-09-11

一、 CARD-RGI 简介 RGI （ Resistance Gene Identifier ）是由 CARD （ Comprehensive Antibiotic Resistance Database ）团队开发的核心 ...

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噬菌体的分类与命名：从传统形态到基因组学 2025-09-10

第一部分：病毒分类与命名的通用规则 1 、病毒分类的负责机构 病毒的分类和命名一般由 国际病毒分类委员会（ ICTV ）   负责，但 ...

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实用组学小工具——大肠埃希菌血清型分析SerotypeFinder和ECTyper 2025-09-05

一、关于大肠埃希菌的血清型鉴定 大肠埃希氏菌的抗原结构主要包括四类：菌体抗原（ O 抗原）、表面抗原（ K 抗原）、鞭毛抗原（ H 抗原）和菌毛抗 ...

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实用组学小工具——大肠埃希菌亚群分类和鉴定 2025-09-05

一、大肠埃希菌亚群介绍 埃希氏菌属（ Escherichia ）包括艾伯特埃希菌（ E. albertii ）、弗格森埃希菌（ E. fergusonii ）、五个埃希菌隐蔽进化 ...

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