生物信息学 之 计算表观遗传学分享 http://blog.sciencenet.cn/u/hongbo919 森罗万象是表观, 追根溯源系遗传。 计算精研千淘漉, 天道酬勤志更坚。

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分享 简单实用的在线维恩图绘制方法
热度 1 2018-10-1 00:18
第一步:登入 http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html ,将各组数据输入到相应的list;计算各组数据的重叠,并绘制圆圈大小相同的维恩图;直接下载可用。 第二步:如果想根据各组数据和重叠的个数调整圆圈大小,登入 http://www.cs.kent.ac.uk/people/staff/pj ...
个人分类: 科研经验|4882 次阅读|2 个评论 热度 1
分享 VM VirtualBox两虚拟机间实现数据同步传输
2018-10-1 00:13
测试环境: Win8+VM VirtualBox 4.3的两个Ubuntu64虚拟机 1、虚拟机采用Host-Only网络 Host-Only的宗旨就是建立一个与外界隔绝的内部网络,来提高内网的安全性。 一个虚拟机:192.168.56.101,另一个为:192.168.56.102 2、现要实现将192.168.56.101中/var/lib/mysql/hg19对拷到192.168.56.102的对应目录中。 ...
个人分类: 科研经验|872 次阅读|没有评论
分享 更改mysql目录的操作
2018-10-1 00:13
近期由于工作需要,发现在linux中默认安装在/var/lib/mysql的数据库太大了,且占用了大量的根目录空间,由于对mysql目录进行了转移。首先将文件复制到一个较大的空间,然后利用软连接来修改默认访问/var/lib/mysql的转向。无需进行额外操作,即可完成mysql数据库文件的转移。 cp -aR /var/lib/mysql/. /pub3/mysq ...
个人分类: 科研经验|558 次阅读|没有评论
分享 [转载]linux下tar.gz、tar、bz2、zip等解压缩、压缩命令小结
2018-10-1 00:08
linux下tar gz bz2 tgz z等众多压缩文件的压缩与解压方法,需要的朋友可以参考下 Linux下最常用的打包程序就是tar了,使用tar程序打出来的包我们常称为tar包,tar包文件的命令通常都是以.tar结尾的。生成tar包后,就可以用其它的程序来进 行压缩了,所以首先就来讲讲tar命令的基本用法:   t ...
个人分类: 科研经验|616 次阅读|没有评论
分享 [转载]盘点55个最实用的大数据可视化分析工具(转载)
2018-10-1 00:05
俗话说的好:工欲善其事,必先利其器!一款好的工具可以让你事半功倍,尤其是在大数据时代,更需要强有力的工具通过使数据有意义的方式实现数据可视化,还有数据的可交互性;我们还需要跨学科的团队,而不是单个数据科学家、设计师或数据分析员;我们更需要重新思考我们所知道的数据可视化,图表和图形 ...
个人分类: 科研经验|620 次阅读|没有评论
分享 关于发布Python软件包
2018-10-1 00:04
1. 首先编写 setup.py文件 参考 http://blog.csdn.net/ponder008/article/details/6592719 2.安装setuptools https://pypi.python.org/pypi/setuptools/ Windows安装 (Invoke-WebRequest https://bootstrap.pypa.io/ez_setup.py).Content | python - Linux下安装Sedtools wget https:/ ...
个人分类: 科研经验|606 次阅读|没有评论
分享 生物信息学技术 之 如何进行物种间同源序列分析
2018-9-30 23:31
随着生命科学的发展,人们越来越关注基因或调控元件的物种间保守性,如何获取这些同源序列则成为生物信息学分析的常见内容。现将这方面的经验总结如下,希望对大家有所帮助! 图文并茂版 ,请下载: 获取同源序列的步骤.pdf 纯 文字版 : gi|341926217 ...
个人分类: 科研经验|1093 次阅读|没有评论
分享 [转载]SAMtool bitwise flag meaning explained
2018-9-30 23:28
If you got samflags and want to know their meaning quickly thenyou can check their meaning interactively following this link. You type in a flag and will get the answer at Piacrd official site. You can also look up the meaning of samflags in a pdf file sam_output in pdf . Or ...
个人分类: 科研经验|619 次阅读|没有评论
分享 Install python package without root (pip安装到指定目录)
2018-9-30 23:26
_______________ 方法1 (亲测有效)_______________ pipinstall--userpackage _______________ 方法2 _______________ pipinstall--install-option=--prefix=$HOME/localpackage _______________ 方法3 _______________ 用户 ...
个人分类: 科研经验|1261 次阅读|没有评论

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GMT+8, 2020-4-6 14:06

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