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热搜: 科学 论文
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分享 pdb restful API 接口不稳定
陈照强 2018-10-18 09:08
PDB RESTFUL API url = 'https://www.rcsb.org/pdb/rest/describeHet?chemicalID=' + ligid 200个ligid中大约有10个是没有返回信息的,但是直接访问是可以获得相应的信息的。 如: https://www.rcsb.org/pdb/rest/describeHet?chemicalID=4T8 http://www.rcsb.or ...
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分享 vim 操作集合
陈照强 2018-10-17 20:30
撤销和恢复 vim u是撤销你刚才做的动作 ctrl+r 是恢复你刚才撤销的动作、
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分享 PDB RESTFUL API xml 解析
陈照强 2018-10-17 11:30
PDB 提供的API 返回的是XML。 我习惯使用scrapy的selector 进行解析,里面是非标准的DOM元素及其属性。 而selector的默认参数是解析HTML,因此会出现属性丢失的情况。 非常重要,解析的时候必须指定type的类型,否则虽然不会出错,但会出现莫名奇妙的结果 ** sel = Selector(text=xmlstr,type='xml' ...
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分享 挑选代表性的蛋白构象 求平均结构
陈照强 2018-10-8 17:22
挑选代表性的蛋白构象 求平均结构 schrodinger 自带上述功能,无需自己编写脚本。 TASKS 中搜索 calculate average structure, structure analysis-calculate average structure,
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GMT+8, 2018-10-19 10:16

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