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科研体会| 临床信息学| 生物信息学| 生物医学文本挖掘| 生物医学文献计量学| 休闲| 教学| 文献计量学| 本体| Bicomb| 智慧健康|

几篇有关文献网络的特色论文（一）：作者同被引分析: 崔雷 2012-2-29 11:14; 用与文献有关的网络研究这一主题在SCI中检索到200多篇相关论文，找到被这些论文引用的高被引论文，对这些高被引论文进行同被引聚类分析（分成了6类），然后，根据高被引论文的聚类结果，找到与高被引论文关系密切的引用论文。下面是对高被引论文聚类比较重要的几篇论文。 1. White, HD. ...; 个人分类: 文献计量学|7364 次阅读|没有评论

BICOMB中对CBM记录的处理: 热度 4 崔雷 2011-11-16 11:00; BICOMB软件里没有对中国生物医学文献数据库（CBM）的处理，这个数据库却又是查找中国医学文献的工具中唯一有主题词的数据库，很多人利用这个数据库进行信息分析。最近，看到一篇用CBM数据进行共现分析的稿件，据说能用EndnoteX4统计高频词，甚至做共现矩阵，甚为惊奇。但是，请 ...; 个人分类: 生物医学文本挖掘|6809 次阅读|15 个评论热度 4

在医学文献库里检索情报学定律: 热度 1 崔雷 2011-10-10 18:58; 在文献检索的教学中，一般是不主张这样做的。我要找三大定律的相关论文，从查全查准的角度说，应该选择最相关的数据库，比如information abstracts之类的。今天忽发奇想，看看在PubMed里检索一下又如何呢？（1）布拉德福定律：策略：Bradford* AND journal* ，结果是62篇，如 Biomedical and health sci ...; 个人分类: 生物医学文献计量学|4891 次阅读|1 个评论热度 1

也许有用（2）: 崔雷 2011-10-4 08:53; 这些主要是和医学文本抽取有关的： Condensing biomedical journal texts through paragraph ranking. (PMID:21330292) Mining MEDLINE for the Treatment of Osteoporosis. (PMID:21494854) Automated extraction of radiation dose information from CT dose report images. ...; 个人分类: 科研体会|3714 次阅读|没有评论

也许有用: 崔雷 2011-10-4 07:48; F1000的Poster，不是正式发表的，多数是会议上的Poster，透露着最新的动态。 Meta-analysis of clinical prediction models Electronic medical record analysis using cloud computing Bioinformatics approaches for analyzing short-read illumina sequences of whole mycobacterium tuberculosis ...; 个人分类: 生物信息学|3580 次阅读|没有评论

多维度多层次的聚类是发现关系的重要手段（2）: 崔雷 2011-7-2 15:23; 最近看了一篇文章，忽然感到，技术又发展了，双聚类都不够了，又出现了多层次聚类了。下面翻译一篇论文的摘要，体会其中的奥妙吧。 Building the process-drug–side effect network to discover the relationship between biological Processes and side effects 建立过程与药物副作用 ...; 个人分类: 生物医学文本挖掘|5856 次阅读|没有评论

多维度多层次的聚类是发现关系的重要手段（1）: 热度 2 崔雷 2011-7-2 15:12; 传统的聚类是单维度的，称作单向聚类，即只对行（对象）或者列（属性）进行聚类，不能对行和列同时进行聚类。如对高频的词或者高被引的论文根据它们共现或同被引聚类，只是把词或者论文进行了聚类。双向聚类 (biclustering, 又称 subspace clustering, ...; 个人分类: 生物医学文本挖掘|11330 次阅读|2 个评论热度 2

投稿：大帽子底下开小差: 热度 3 崔雷 2011-4-2 08:37; “该文以XXXXX的新理论（新概念）作为基础，介绍了本单位开展服务的一些经验。但是，二者不是有机的结合，即：没有XXXXX的理论（概念），该单位也会采取这些措施（如增加开馆时间，增设网络设备，树立为用户服务的理念......）来加强服务的工作；反过来，该单位所采取的一些工作措施，也不是基于XXXXX之原理而制定 ...; 3929 次阅读|3 个评论热度 3

Medline数据库中相关记录的计算方法【节译】: 热度 1 崔雷 2011-2-15 10:50; 我们将寻找相关文献的问题归纳为如下模型：给定某篇用户表示感兴趣的文献，系统的任务就是找到用户也会想要浏览（ examine ）的文献。因为这种活动往往发生在更为广泛的信息搜寻的行为之中，相关性可以作为感兴趣的指标，即，检索其他相关的文献。但是，我们用更宽泛的术语来描述这个问题：其他文献之所以成为感兴趣的 ...; 个人分类: 生物医学文本挖掘|4300 次阅读|1 个评论热度 1

审稿中遇到的形形色色: 热度 8 崔雷 2011-1-24 12:55; 给几个信息学及医学信息学专业的杂志审稿，杂志水平参差不齐，稿件呢自然也是有高有低的，但是无论如何，说心里话，这真是个很好的了解和学习本专业甚至相关专业新进展和新名词的机会：很多新词让我硬着头皮去读，然后去找相关的资料，这个期间，我主动或者是被动地学习了很多新知识。然而有趣的是，在找资料过程中，偶尔 ...; 个人分类: 科研体会|5468 次阅读|9 个评论热度 8

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