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GO注释文件各列意义

已有 6586 次阅读 2012-12-11 17:39 |个人分类:笔记|系统分类:科研笔记

1: DB    #该文件所使用的数据库
2: DB_Object_ID    #数据库的登记号
3: DB_Object_Symbol    #若该基因有通用名称,则使用该名称,否则使用系统编号
   一个基因可以有多个通用名称
4: Qualifier (optional)     #可选项目
    使用'NOT'、'contributes_to'、'colocalizes_with'中的一个或多个
    用于修饰GO注释:非、有助于、共同作用。可使用'|'分隔。    
5: GO ID    #GO注释词id
6: DB:Reference(|DB:Reference)    #该注释使用的参考文献
7: Evidence    #GO注释的证据代码,其意义参照http://www.geneontology.org/GO.evidence.shtml
8: With (or) From (optional)    #可选项目
   使用with和from对GO注释进行修饰
9: Aspect    #属于GO注释三大部分的哪一个(Function、Process、Component)
10: DB_Object_Name(|Name) (optional)    #可选项目
   基因产物的名称
11: DB_Object_Synonym(|Synonym) (optional)    #可选项目
   系统编号+任何其他非标准名称
12: DB_Object_Type    #注释对象的类型:基因、蛋白质等。
13: taxon(|taxon)    #该基因所属生物的物种分类号
14: Date    #该注释生成的时间,格式YYYYMMDD
15: Assigned_by    #作者



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