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生物信息| 非编码RNA| 其他| 软件| 网站| python| 每日文章导读|

在线plotly绘制动态旭日图，展示复杂数据层次结构: 陈明杰 2024-9-7 19:38; 探索数据的层次之美：旭日图，以环环相扣的视觉效果，清晰展现数据的层级关系。搭配Plotly的动态可视化技术，不仅让数据层次一目了然，更通过交互式操作，让用户轻松探索每个层级的详细信息，享受数据探索的乐趣。 &nbs ...; 683 次阅读|没有评论

以人口金字塔图为例，在线绘制左右双侧堆叠条形图: 陈明杰 2024-9-4 12:20; 导读：人口金字塔（population pyramids）用于展示一个特定人口的年龄和性别分布。本质上是一种水平条形图。左侧是男性的数据，右侧是女性的数据。 &nbs ...; 509 次阅读|没有评论

在线绘制哑铃图（dumbbell chart）展示基因拷贝数变异（CNV）: 陈明杰 2024-9-1 23:38; 导读：哑铃图的名称来源于其形状，它看起来像一个哑铃，有两个圆形的“重量”在两端，通过一根“杆”连接。常用于展示两个或多个数据集之间的差异。本文介绍了如何使用哑铃图展示基因的拷贝数变异。 &nb ...; 517 次阅读|没有评论

使用corrplot绘制行、列不同，且带有p值显著性标注的相关系数图: 陈明杰 2024-8-30 20:00; 导读：相关系数衡量两个变量之间的线性关系，通常以N*N的矩阵形式展示。例如样品vs样品，或者基因vs基因的相关性。本文介绍了使用corrplot R包绘制M*N的相关系数矩阵，例如M个基因表达与N个代谢物信号间的相关性，同时带上p值显著性标注。 ...; 809 次阅读|没有评论

在线绘制带VIP维度的代谢组学火山图: 陈明杰 2024-8-27 14:52; 导读：代谢组学火山图是在常规火山图的基础上，以点的大小表示PLSDA或者OPLSD模型的VIP值。以展示实验组 vs 对照组的差异代谢物。 Journal of Translational Medicine文章《Metabolomics combined with network pharmacology reveals a role for astragaloside IV in inhibiting enterovirus 71 replicatio ...; 815 次阅读|没有评论

Nature同款富集分析结果条形图叠加基因: 陈明杰 2024-8-26 22:50; 导读： Nature同款、高颜值富集分析结果条形图，将富集名字标注在条形上，并在条形的下面添加一行基因名。既能节省空间，又能展示更多维度的信息。 Nature 文章《CHIT1-positive microglia drive motor neuron ageing in the primate spinal cord》中的富集结果条形图。该图展示了猴脊髓单核测序结果中，小 ...; 812 次阅读|没有评论

使用mfuzz进行时间序列转录组数据聚类，划分相似表达模式基因群: 陈明杰 2024-8-11 09:11; 导读：针对具有时间序列（例如0h、4h、8h、12h）或不同发育阶段（例如4cell、8cell、64cell）的转录组数据，mfuzz基于模糊聚类原理，识别出具有相似表达模式的基因群。使用折线图展示每群基因的表达变化，以帮助研究者推测感兴趣表达模式基因群的生物学功能。这张图展示了9个cluster的结果，由9个子图和一个col ...; 631 次阅读|没有评论

微生信 -- 20万+科研用户信赖的生信分析云平台: 陈明杰 2024-8-4 15:27; 导读：微生信云平台自上线以来，累计帮助用户发表英文文章 3700+ 篇，中文文章 3000+ 篇。已经成为全球超过 20w+ 科研用户值得信赖的生信分析云平台。 1 ，粘贴数据，一键出图微生信云平台以 270 多款在线绘图、分析模块为基础，致力于 0 代码在线分析数据， 0 代码在线绘制科 ...; 973 次阅读|没有评论

在线绘制clusterprofiler KEGG，GO富集分析结果自定义条目cnet图: 陈明杰 2024-7-27 15:51; 导读使用clusterprofiler R包做完富集分析后，可以使用cnetplot绘制一个cnet图，默认是top5的条目作图。本文展示了如何使用微生信平台绘制自定义条目的cnet网络图。 clusterProfiler 是一个在生物信息学领域广泛使用的R包，它提供了多种功能来分析和可视化基因集的功能特性。其中，cnetplot 是 e ...; 1215 次阅读|没有评论

在线绘制临床cox分析结果森林图（forest plot）: 陈明杰 2024-7-23 08:13; 导读森林图是临床医学研究中非常常见的一种图。在生存分析的背景下，森林图可以用来展示不同变量风险比的估计值和置信区间，以及它们的统计显著性。本文对森林图中各个元素进行了简要说明，并展示了使用微生信云平台在线绘制森林图的详细步骤。森林图森林图是一种非常灵活的可视化工具，不仅可以 ...; 945 次阅读|没有评论

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