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置顶 · 分享 人生苦短,我用中文PubMed搜索文献
2017-8-2 12:50
中文PubMed ,3000多万篇中英文双语生物,医学文献检索平台。旨在翻译、分享生命科学、医学、药学等最新科技论文,提供文献检索、翻译、下载、评论等服务,打造中文 PubMed 文献数据库,用 最熟悉的中文 了解最新科技资讯,助力祖国科研! 支持 中英文、拼音等搜索 ,并带有常见术语的划词解释, PubMed 内容纠 ...
个人分类: 生物信息|1942 次阅读|没有评论
分享 CFEA:游离DNA表观遗传修饰(5mC、5hmC、核小体定位)数据库
陈明杰 2019-8-31 17:06
cfDNA是疾病液体活检的一种强大工具,而cfDNA的表观遗传修饰对于疾病检测和分类也是至关重要的。 作者使用公共数据库数据,开发了标准化质控、分析流程,并构建了一个网络服务器,以在基因组规模上查询、可视化5mC、5hmC和核小体定位信息。 使用该数据库,用户能够: 1,浏览来自血浆或血清的cfDNA的表观遗传信息 2, ...
个人分类: 网站|638 次阅读|没有评论
分享 [转载]PACES:预测mRNA中的N4-乙酰胞嘧啶(ac4C)修饰位点
陈明杰 2019-8-19 10:43
N4-乙酰胞嘧啶(ac4C)是一种高度保守的RNA修饰,并且是mRNA中第一个描述的乙酰化事件。已经证明mRNA中的ac4C参与mRNA稳定性调控,加工和翻译,但是仍然不清楚ac4C起作用的确切方式。此外,ac4C以生理学上相关的水平广泛分布于人类转录组中,并且迄今为止,实验仅检测了一小部分修饰序列。本研究中,我们开发了一个人类mR ...
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分享 [转载]MM-6mAPred:基于马尔科夫模型识别DNA 6mA位点
陈明杰 2019-7-30 17:13
定义:DNA上的6mA位点,已经发现6mA与胚胎发育、应激反应等密切相关。 bioinformatics上新发表的使用马尔科夫模型预测DNA 6mA位点的网络服务器 输入为fasta格式序列 输出为excel表格,告诉你是否发生6mA,ratio越大越可靠。 物种目前仅限于rice。 参考: MM-6mAPred: Identifying DNA N6-methylad ...
个人分类: 网站|530 次阅读|没有评论
分享 [转载]2019年影响因子下载
陈明杰 2019-6-23 13:52
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个人分类: 网站|731 次阅读|没有评论
分享 [转载]pLoc-mAnimal -- 以单位点和多位点预测动物蛋白质的亚细胞定位
陈明杰 2019-6-2 10:35
细胞的许多重要功能以及它们的生长和繁殖是通过位于不同细胞器或位置的蛋白质分子执行的。面对蛋白质序列的指数增长,开发快速且有效的注释蛋白质亚细胞定位的方法是有挑战性的。 越来越多的证据已经表明蛋白质能同时存在于两个或多个不同的亚细胞位点,或者在它们之间移动。不幸的是,大部分现有计算方法仅能处理单标记 ...
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分享 [转载]Protein-Sol -- 一个从序列预测蛋白质可溶性的网络工具
陈明杰 2019-3-20 07:10
蛋白质可溶性是工业和治疗应用中一种重要的性质。尽管有对相关物化性质越来越多的理解,但是预测仍是一项挑战。 Protein-Sol从序列预测蛋白质可溶性。使用无细胞表达系统中可用的大肠杆菌蛋白质可溶性数据,计算了35种基于序列的性质。从分开低可溶性子集和高可溶性子集中确定特征权重。 输入序列: 输出: 模型返 ...
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分享 [转载]Tomato Expression Atlas -- 番茄表达地图
陈明杰 2019-3-13 23:16
随着新的高通量DNA测序技术的发展和递减的成本,大量基因表达数据集正在以加速产生,但是是复杂难以可视化的。需要新的,更加交互和直观的工具以可视化表达数据的时空环境,并帮助阐明基因功能。我们使用番茄果实作为一种模式植物,开发了番茄表达地图(Tomato Expression Atlas)以促进高效数据分析,除了候选基因鉴 ...
个人分类: 网站|706 次阅读|没有评论

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GMT+8, 2019-11-14 09:36

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