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我们经常遇到需要截取一条基因序列中的一段进行分析,例如线粒体全序中的某个功能基因片段。通常我们使用序列编辑软件操作,但是除了操作方法繁琐意外,还容易出错。下面我们将介绍一种使用clustalX软件截取序列片段的方法。
首先clustalX打开序列,在file菜单中选择save sequences as(图1)
图1 |
在弹出的对话框中,选择保存序列的文件格式,如fasta格式。点选“Use range information”(图2),填上起止核苷酸序号。值得注意的是需要改变文件名字,或者保存路径,软件默认保存在原来的文件夹,并以相同的文件名,所以容易将原来的序列文件覆盖,而我们只是截取了序列的一部分,从而是序列的信息量变的不完整。
图文版请参考附件
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