Six degree of separation—六度分离

简建波 2010-12-16 15:46

世界很小，经常提起时，就发现通常我们都有共同认识的人。经常听人提起过或者感受到过这种现象，原来世界是如此之小。一直不知道其来源，今天偶然看到出处六度分离概念：1967年美国社会心理学家StanleyMilgram做的一个实验，这个实验表明，两个随机的美 ...

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phenotype vs genotype

简建波 2010-12-13 18:01

PhenotypingGenotyping PhenotypeGenotype Phenomics Genomics Phenotypic variationGenomic variation What is phenomics? What 's genomics? How to phenotype and how to genotype? So complex, so fine!

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全基因组选择 genomic selection

简建波 2010-12-1 17:22

科研就是将简单的东西复杂化，复杂之后就可以尽情的讨论。如今这基因组学就是典型之一，研究来研究去，颠来倒去的，最后所有的东西就都变成了数字游戏了，统计分析特别是生物信息统计学这玩意从高了说就高深莫测，让人丈二和尚摸不着头脑，说低了就跟买彩票一样，不过是骗人的把戏。如今的全基因组玩来玩去越来越复杂， 遗 ...

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家鸡的起源

简建波 2010-11-23 18:15

鸡（ Gallusgallusdomestica ）属于鸡形总目（Galliformes）雉科（Phasianidae）原鸡属（Gallusgallus），是人类饲养最普遍的鸟禽类。 家鸡源出于野生的原鸡，其驯化历史至少约4000年，但直到1800年前后鸡肉和鸡蛋才成为大量生产的商品。除了肉鸡和蛋鸡之外，还有 ...

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SNP discovery

简建波 2010-11-22 18:01

SNPdiscoverybecomesveryverypopular: Eck,S.H.,A.BenetPags,K.Flisikowski,T.Meitinger,R.FriesandT.Storm.2009.Wholegenomesequencingofasingle&nbs ...

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SNP genetic map for scarffold assembly

简建波 2010-11-22 17:39

遗传连锁图谱(genetic linkage map)指以分子标记为主体构成的染色体线状图，它表示不同分子标记在染色体上的相对位置或排列情况。 传统的构建遗传图谱的分子标记主要是SSR、RFLP、AFLP等，随着高通量测序技术的发展，SNP的发掘已经非常容易，因此应用SNP构建 遗传图谱也就随之诞生。但目前应用SNP图谱辅助scarffold ...

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RAD marker

简建波 2010-11-16 12:20

RestrictionsiteAssociatedDNA(RAD)markersareatypeofgeneticmarkerthatcanbeusedforgeneticmapping.最近经常碰到RAD tag sequencing的问题，发表下看法:这种方法适合于低成本的寻找marker，特别是在大 ...

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GWAS-----全基因组关联分析

简建波 2010-11-12 17:28

GWAS在人类疾病的研究中非常热门，但是在动植物的研究中却刚刚开始起步，正处在向人类GWAS方面进行借鉴的过程。但是GWAS对于动植物的研究可能将更加具有优势。由于动植物不像人类那样可以随意构建群体以及随意重组。以下是到现今在动植物方面的gwas研究paper！ 目前 ...

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家鸡基因组学研究中的又一篇经典PNAS paper

简建波 2010-11-2 21:11

家鸡基因组学研究中的又一篇经典PNAS paper Genome-wide assessment of worldwide chicken SNP genetic diversity indicates significant absence of rare alleles in commercial breeds William M. Muira, Gane Ka-Shu Wongb,c, Yong Zhangc, Jun Wangc, Martien A. M. Groenend, Richard P. M. A. Crooijmansd, H ...

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