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LC-MS/MS| 蛋白质谱| 蛋白质组学| 蛋白修饰| 蛋白质组学生信软件| DIA|

【分享篇】癌症蛋白相互作用与AP-MS: 崔蕴博 2020-5-5 13:12; 本文1400字，阅读需要5分钟大多数的细胞信号和监控回路是通过密集的蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPIs)维持的。基因突变，表观遗传学的改变，以及细胞微环境的改变干扰PPIs的模式，从而导致癌细胞肿瘤生长。越来越多的证据表明，靶向特异性PPI的药物可能比抑制原癌基因蛋白活性的药物具有更高的特异性和疗效。因此，在 ...; 个人分类: 蛋白质组学|3495 次阅读|没有评论

【方法篇】基于LC-MS/MS手段分析与MHC结合的肽序列: 崔蕴博 2019-5-23 16:56; 此文1200字，阅读需要5分钟肽抗原与主要组织相容性复合体（MHC）编码的分子结合，并呈现在细胞表面形成T淋巴细胞的靶分子。自适应免疫系统这一关键环节可有助于消灭病原体感染细胞和癌症细胞，以及产生相应抗体，那么对这些抗原肽的鉴定，给新疫苗开发带来新的契机，新疫苗的目标就 ...; 个人分类: 蛋白质组学|3622 次阅读|没有评论

【方法篇】研究RNA互作结合蛋白（RBPs）的方法: 崔蕴博 2019-5-14 14:29; 由于RNA结合蛋白（RBPs）显著的生物学功能，它们的表达情况和活性状态能否提供细胞系统的诸多信息。科学家们最近开发了一种新的技术手段，可称为相互作用体捕获手段，用于识别细胞中的活性RBPs。利用紫外线交联RBPs与RNA聚合物，并通过寡聚dT磁珠共价结合蛋白质。经过清洗后，再通过质谱检测结合蛋白。此实验 ...; 个人分类: 蛋白质组学|9588 次阅读|没有评论

【工具篇】怎样使用Scaffold查看蛋白质二级谱图: 崔蕴博 2019-3-31 21:47; 下载Scaffold free viewer Scaffold是一款可视化质谱数据分析软件，一个ID号只能绑定一台电脑的商业化收费软件，但是可以下载其免费版ScaffoldViewer进行数据解析，此文主要介绍查询二级肽段谱图功能，此软件Scaffold Viewer只能打开商业版scaffold生成的任意*.SF3文件，然后就可以对数据进行 ...; 个人分类: 蛋白质组学|4952 次阅读|没有评论

【讨论篇】定量蛋白质组学：在基础科研和医疗应用中的机遇与挑战: 崔蕴博 2018-12-4 10:54; 最近有科学家讨论近十年来质谱为基础的蛋白质组学技术的发展，反思现有的挑战和局限，并探讨当前的问题以及定量蛋白质组学在分子系统生物学、临床研究和个性化医疗中的未来应用。蛋白质构成细胞主要分子机制，是生物分子药物主要的靶向目标。它们被组织起来在不同的功能模块和信号网络中，协同起来调控细胞功能以及确 ...; 个人分类: 蛋白质组学|5191 次阅读|没有评论

工具篇：质谱上机前酶解处理方法之比较: 崔蕴博 2018-11-25 22:49; 通过高效液相串联质谱（LC-MS/MS）对生物系统中全蛋白进行定性定量，已经成为一种主流的分析工具。大规模的蛋白组研究通常依赖于蛋白被消化成肽段，然后进行后续的定性定量分析。因此蛋白的消化效率对于后续质谱实验至关重要，质谱的结果与样本类型，裂解条件，酶解消化和分馏方法等等密切相关，最近有 ...; 个人分类: 蛋白质组学|15907 次阅读|没有评论

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