生物技术创新创业分享 http://blog.sciencenet.cn/u/SNPs 美国HudsonAlpha研究院的研究员。做分子鉴别诊断平台技术的开发和免疫组库基础科研。

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摄影艺术与诊断科学
热度 4 2015-11-16 02:44
科学要严谨,艺术要奔放,两者本不相融,可是常常有密切相关。 最近分析免疫组测序数据,脑子里整天想的都是如何提高诊断信号,如何降低背景。突然发现,这些信噪比的调节和摄影很相似:把光圈放大,曝光时间长些,收集到的信号就多,可是背景噪音也会跟进来。如何调整光圈,快门,ISO来得到最好的照片?这是著名的曝光三 ...
个人分类: 免疫组库新领域|7261 次阅读|4 个评论 热度 4
论文发表在eLife上,免疫组测序会议结束
热度 2 2015-10-2 23:14
一直忙着开发技术,专利写了一大堆,论文发表得有限。最近我们斯坦福的合作者发表了一篇 重要文章 : 该研究把高精度流式细胞仪技术和高通量免疫组测序技术结合研究B淋巴细胞的发育。结果表明B细胞还可以细分,具有不同的生理和病理功能。 文章发表在比较新的 开源杂志elife上 。这个杂志很有特色,2012年创办,头一 ...
个人分类: 免疫组库新领域|7503 次阅读|2 个评论 热度 2
在美国免疫年会上的演讲视频(百度云盘分享)
热度 1 2015-6-20 09:49
前几天把在美国免疫年会上演讲的视频放在网上了,可是许多国内的朋友没法“翻墙”去看或者下载。最近回国把视频分段放在百度云盘上,便于大家观看分享: (1) 为什么要用二代测序做免疫组? (2) 如何做免疫组测序? (3) 如何使用免疫组数据? 免疫组多样性指数 免疫组变化指数 免疫组共享指数 ...
个人分类: 免疫组库新领域|5888 次阅读|1 个评论 热度 1
在美国免疫学年会上的讲课录像:免疫组测序技术的应用
2015-5-23 10:28
我在2007年开始研发免疫组测序技术,经过“八年抗战”,最近有些突破性进展。这些进展也得到了学界的认可:作为一个门外汉(我不是免疫学家),五月份被美国免疫协会大会邀请 做学术报告 , 虽然有点迟,总算被认知了。 点击下图 链接 录像: 其实,我在免疫组测序方面的工作几乎是在实时地向大家汇报, ...
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Ebola死亡率是50%,这是命还是运?
热度 15 2014-10-16 08:49
许多感染性疾病的死亡率都不是很高,50%已经算是高的了。非典的死亡率大概才有10%。 为什么有的病人死,有的病人能活下来?这是命还是运? 按照老的说法,命是注定的,一定要发生的;而运则是一个偶然,是可能规避的。用科学的话说:命是遗传因素,运就是环境因素。 那么,患Ebola后死去的(或者活下来的)是遗传因素决 ...
个人分类: 免疫组库新领域|10726 次阅读|16 个评论 热度 15
什么情况下贫富两极分化有理?
热度 12 2014-6-4 06:49
今天的华尔街日报有篇文章似乎在给美国的贫富两极分化辩护: 文章的开头说,从福布斯杂志财富排名400强的情形看,美国的富人财富积累速度惊人。在1982年,排行榜出现的第一年,前400名中仅有13个财富超过十亿,只要拥有有七千五百万的资产就能挤进排行榜。可是2013年的排行榜中全都是十亿以上的身价,甚至有61个十亿以 ...
个人分类: 免疫组库新领域|4786 次阅读|12 个评论 热度 12
治未病,病未治,和未治病
热度 5 2014-3-5 01:16
中医传统讲“上医医未病之病;中医医将病之病;下医医已病之病”。 可是,防病与未然到底是理想还是现实? 治未病,理论上是好的,可是实践中能和未治病区分开来吗? 治未病和病未治很好区分,因为后者有症状,只要症状持续存在,病就未治愈。 然而,治未病和未治病就很难区分了: 说防止了一个病的发生,如何证明这 ...
个人分类: 免疫组库新领域|5339 次阅读|6 个评论 热度 5
肿瘤到底是怎么发生的?
热度 4 2013-12-23 03:21
周末读一些有关用二代测序技术研究肿瘤的文章,一个最基本的假设就是: 肿瘤的起因是体细胞突变 。 比如Nature Review上Ian Watson(2013)的文章一开始就说:“...much or our current understanding of cancer genetics is grounded on the principle that cancer arises from a clone that has accumulated the requisit ...
个人分类: 免疫组库新领域|6446 次阅读|5 个评论 热度 4
转让技术使用权:生物技术的连横策略
热度 11 2013-8-9 09:58
今天我们的战略合作伙伴通过公关公司发布了消息(Press Release)宣布从我们这里拿到了免疫组库测序技术在血液病复发诊断(minimal residual diseases)的独家权限: Sequenta 公司位于加州旧金山,创办人Tom也是一个系列创业者,前面一个公司上亿美元卖给了生物芯片的旗舰公司Affy。再次创业刚巧赶上二代测序技术的 ...
个人分类: 免疫组库新领域|5781 次阅读|17 个评论 热度 11
蛋白组学和免疫组学
热度 8 2013-7-5 06:30
昨天在汕头大学医学院讲课,顾江院长提出一个很好的问题:如果把免疫组和蛋白组比,是否是蛋白组更直接? 组学,始于基因组(genomic), 后来有了蛋白组,代谢组,表型组等,我们又做了免疫组。 所有这些所谓的组学都有一个共同的特点,就是用高通量的方法产生大数据。另外,所有这些组学的目的也都是在寻找更好的诊断和治 ...
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GMT+8, 2020-11-24 04:15

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