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置顶 · 升级版|16srRNA微生物多样性测序报告解读
2021-4-1 17:29
微生物多样性测序(扩增子测序)是基于二代高通量测序对16S/18S/ITS等序列进行测序。可以同时检测样本中的优势物种、稀有物种及一些未知物种的检测,获得样本的微生物群落组成以及相对丰度。 相信关注我们的小伙伴对此并不陌生。 这次我们整合了大家平时会遇到的一些问题,在原有的基础上对报告进一步完善。 ...
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置顶 · [转载]多快好省的宏基因组研究技巧 — 资深专家分享
2020-4-27 13:34
谷禾健康 原创 近年的研究热点集中于环境和生物体相互作用的微生物群体,而大量复杂的微生物群体存在培养困难,构成复杂(包括细菌、古菌、真菌、原生生物、病毒甚至小型真核生物)。因此 如何用高通量精准的了解这些群体的构成,基因功能分布以及具体的表达活性和代谢状况 成为首要问题。 高通量测序技术 ...
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置顶 · [转载]微生物多样性测序结果如何看?
隐藏 2019-11-18 14:37
原文 如何读懂和利用你的微生物多样性测序结果? 谷禾健康 原创 做过16s测序的小伙伴们都知道 测完之后会拿到一份结果报告 但这并不代表可以开始写文章了 看似一大堆数据图表却不知如何下手 这是很多人头疼的地方 那么怎样给报告中的数据赋予灵魂 让它真正成为对你有帮助的分析呢? 今天我们来详细解 ...
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[转载]早期生命菌群和呼吸道感染
牛耀芳 2020-8-17 15:10
谷禾健康 呼吸道感染(RTIs)是全世界儿童发病和死亡的主要来源。在过去的十年中,已经清楚的是,呼吸道和肠道菌群与呼吸道感染的发病机理有关。宿主和环境因素可以促使呼吸微生物群在早期生活中走向成熟,这又与对呼吸道感染的持续易感性有关。近日,荷兰研究团队发表在 《Cell host microbe》 的一篇综述论 ...
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膳食胆固醇通过调节肠道微生物群和代谢产物驱动脂肪肝相关的肝癌
牛耀芳 2020-7-30 14:48
谷禾健康 高脂饮食会诱发肥胖、胰岛素抵抗、葡萄糖耐受不良和脂肪变性,而脂肪性肝炎向纤维化和肝细胞癌(HCC)的进展主要与高膳食胆固醇有关。非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)是一类代谢疾病,可从脂肪肝进展至脂肪性肝炎,进一步导致肝硬化甚至肝细胞癌(HCC),胆固醇被认为是疾病发展过程中主要的脂毒性分子。 ...
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[转载]菌群最新资讯热评|消毒剂正在改变微生物群,微生物是否可以增强癌症免疫疗法
牛耀芳 2020-7-24 12:12
本文原创: 谷禾健康 01 杀菌剂和消毒剂正在改变微生物群落 随着 COVID-19 疫情的发展,相应的抗菌药物耐药性的加速确实令人担忧。疫情下,加剧了抗生素的大规模滥用,不仅用于治疗人类和动物疾病,而且也用于动物食品生产系统。 近日,BMJ发表一篇有关COVID-19的文章,消毒剂正在改变微生物群落。 幸 ...
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[转载]被迫改变生活方式对少数族群的微生物群和健康的影响
牛耀芳 2020-7-21 11:21
现代生活方式通过部分改变微生物组而增加了人类患慢性病的风险。但是,对于少数族群而言,生活方式的改变将对健康产生怎样的影响,这方面的研究并不多。近日,爱尔兰国立科克大学Fergus Shanahan及其课题组的最新研究:Microbiome and health implications for ethnic minorities after enforced lifestyle changes 揭示了 ...
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[转载]肠道细菌产生的神经递质调节宿主的感觉行为
牛耀芳 2020-6-28 13:36
谷禾健康 近日,美国布兰代斯大学Piali Sengupta和Michael P. O’Donnell研究小组发现,肠道细菌产生的神经递质调节宿主的感觉行为(DOI:10.1038/s41586-020-2395-5)。相关论文于2020年6月17日在线发表在《自然》杂志上。该研究结果表明,肠道细菌产生的神经递质模拟了同源宿主分子的功能从而越过宿主调控感觉决定,这 ...
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[转载]菌群左右下的免疫力天平——免疫失衡疾病背后的新机制
牛耀芳 2020-6-3 12:02
刚刚,来自美国耶鲁大学的免疫学专家MartinKriegel及其同事在自然评论《 NatureReviews 》上在线发表了综合评论文章:Host–microbiotainteractionsinimmune-mediateddiseases(免疫介导疾病中的宿主-微生物群相互作用)。 以下是文章内容。 宿主-微生物相互作用 ...
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[转载]COVID-19患者住院期间的肠道菌群变化
牛耀芳 2020-6-2 11:31
新冠肺炎是一种由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引起的呼吸道疾病,截至2020年5月1日,全球已有330多万人感染,致病和死亡率高,人类生命受到了极大威胁。近日,来自香港中文大学医学院Siew C. NG教授及其团队在国际顶级期刊《Gastroenterology》发表的一篇题为:Alterations in Gut Microbiota of Patients With COVID-19 Du ...
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[转载]肠道菌群组成影响肾细胞癌患者肿瘤免疫治疗的应答
牛耀芳 2020-5-22 14:53
谷禾健康原创 转移性肾细胞癌(RCC)长期以来被认为是一种“免疫性恶性肿瘤”,对不同的免疫疗法敏感。免疫检查点阻断疗法(ICB)的发展,使肾细胞癌(RCC)的临床预后发生了革命性的变化。虽然如此,但治疗响应的持续时间以及预测的改善仍旧没有满足医疗需求。虽然人们已经认识到抗生素(ATBs)会降低ICB在各种恶性肿瘤中 ...
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[转载]营养不良和口服万古霉素对人体肠道菌群和营养吸收的影响
牛耀芳 2020-5-12 13:49
肥胖和营养不良是普遍面临的健康问题,而肠道菌群在其中扮演的什么样的角色?最近一项研究通过交叉过量、过低饮食干预以及随机双盲万古霉素抗生素实验,揭示了不同热量摄入和抗生素会破坏肠道菌群特点代谢产物(如:丁酸和其他短链脂肪酸)影响肠道屏障,并改变特点微生物群落(如阿克曼菌),这种变化是粪便热量流失的原 ...
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肠道微生物群与心血管疾病:机遇与挑战
牛耀芳 2020-3-31 11:20
谷禾健康 原创 冠状动脉疾病是世界范围内最常见的健康问题,也是导致发病率和死亡率的主要原因。肠道菌群在人类新陈代谢、免疫力等方面扮演重要角色,与冠状动脉疾病之间也存在相关性。 本 文 要 点 1、肠道微生物群与CAD发展之间的因果关系尚未得到证实。 2、必须通过 微生物代谢产物 和与 免疫系统 的相 ...
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