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置顶 · Python for Bioinformatics 为生物信息学设计的Python教程
热度 11 2011-11-21 20:46
由于这本书较旧,本书的中文译本将不出版。新书《Python生物信息数据管理》己出版,网上有售。谢谢大家的关注和支持。应多位朋友的要求,把该《Python for Bioinformatics》一书的旧稿放到数据空间的博客上,点击即可,供大家参考 (2017.1.13): 前言 第一部分 编程 第一章 ...
个人分类: 生物信息|37479 次阅读|21 个评论 热度 11
【旧文新发】支持向量机在生物信息学中的应用
卢宏超 2021-2-10 10:31
这是2005年在清华大学学习张学工老师的《模式识别》课程时的作业。
个人分类: 生物信息|480 次阅读|没有评论
你所在的领域里,有哪些堪称开山之作的论文?
卢宏超 2017-6-13 12:36
我在@知乎回答了问题: “你所在的领域里,有哪些堪称开山之作的论文?” ,分享在这里: 作为生物信息的码农,生物信息领域的开山之作,个人觉得这篇BLAST(局域联配搜索基础工具)的论文是当之无愧的: Basic local alignment search tool SF Altschul , W Gish, W Miller , EW Myers … - Journal of ...
个人分类: 生物信息|3488 次阅读|没有评论
《Python生物信息学数据管理》译者序
热度 1 卢宏超 2017-1-17 18:09
随着生命科学科研领域的需要和测序技术的发展,生物信息这个交叉学科近年来愈来愈兴旺起来,从业者也越来越多。与传统的理论和实验学科不同,生物信息是一门数据科学,这就需要从业者具备一定数据收集、管理、处理和分析的能力。在海量的组学数据面前,使用别人开发的软件及图形界面操作往往不能解决工作中的问题 ...
个人分类: 生物信息|7826 次阅读|1 个评论 热度 1
生物信息学和Linux
卢宏超 2014-10-24 15:28
在“知因网”回答的一个问题,分享在这里。 http://www.knowgene.com/question/2286 问: 生物信息学是否需要掌握Linux系统操作呢?一般的生物信息分析软件基于Linux系统开发的,那么当我们需要使用时是否需要掌握该系统的功能才能够正确的使用分析功能呢? 答: 分两个层 ...
个人分类: 生物信息|8486 次阅读|没有评论
学习算法的那点事儿
热度 4 卢宏超 2014-3-25 18:21
最近chinaunix论坛进行了关于算法学习的讨论( http://bbs.chinaunix.net/thread-4130313-1-1.html ) ,下文是我的一点感受,放在这里: 1. 平常是如何学习(夯实)算法和数据结构基础知识的? 本人的工作是生物信息,原来不是计算机专业出身,考博士的时候恶补了一下算法知识,用的是严蔚敏的算法书,受益颇深 ...
个人分类: 生物信息|6925 次阅读|8 个评论 热度 4
安装hadoop2.2.0 到Windows 7笔记
热度 1 卢宏超 2014-1-15 13:12
最近工作中可能用到大数据分析,对 MapReduce 很感兴趣就准备学习 Hadoop ,先在自己 ...
个人分类: 大数据|7301 次阅读|4 个评论 热度 1
介绍国外几位生物信息学家(10)~~译后感
热度 2 卢宏超 2011-5-26 12:48
我化了一些时间翻译学习了Jones和Pevzner著的 IntroductiontoBioinformaticsAlgorithms 一书中九位著名生物信息学家的介绍,收获很多,这里写下些心得体会,留下个记录,也希望给同道留些参考。 这本书是生物信息学算法导论,该书成于2004年,书中对那时生物信息学的常用算法 ...
个人分类: 生物信息|8618 次阅读|6 个评论 热度 2
介绍国外几位生物信息学家(9)~~David Haussler
卢宏超 2011-5-25 13:30
DavidHaussler , 1953 年 10 月生于 California, 现驻 UniversityofSantaCruz(UCSC) 计算机科学系,任 UniversityofCalifornia 的校长,也是 HowardHughesMedicalInstitute 的研究员。他是在生物信息中应用机器学习的先驱,对人类 ...
个人分类: 生物信息|5238 次阅读|没有评论
介绍国外几位生物信息学家(8)~~Ron Shamir
卢宏超 2011-5-24 10:19
RonShamir , 1953 年生于 Jerusalem, 是 TelAvivUniversity 计算机科学学校的教授。他在 HebrewUniversity, Jerusalem 获得了数学和物理学学士学位,在 UniversityofCaliforniaatBerkelay 的运筹学专业获博士学位。他是把复杂巧妙的图论技 ...
个人分类: 生物信息|4472 次阅读|没有评论

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