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文献数据库标引质量评价研讨会发言稿

已有 1484 次阅读 2016-3-17 20:38 |个人分类:知识组织|系统分类:科研笔记

还有几天,我继续准备资料。

3月22日  中国知网CNKI召开文献数据库标引质量评价研讨会

我的发言稿如下:与大家交流研讨的几个问题。

标引质量研讨问题

1.    计算机辅助标引文献主题的质量控制

计算机自动标引主题词很难,国内很多文献数据库采用关键词-主题词对应表进行文献主题标引,标引质量取决于对应表的全面性和准确性。如果对应表中的词汇不全,有的关键词和文本词就无法对应到正确的主题词。

对应表词汇不全、会造成漏标,特别是文献的重要主题概念,如果漏标,就会影响检索查全率。如果对应词主题词不准确,就会影响检索查准率。

例如:这篇文献中的杂交对应了遗传杂交,因此对应表中必须加一个杂交外科外科手术。

在自动标引用的词库里要加一个杂交外科

计算机辅助标引系统需要多年的词库积累,对应表的维护、增词、纠错。因此,对标引结果进行人工审核是必须的,可以发现问题,纠正错误。中国知网的医院知识仓库(CHKD)有一套严密的标引质量控制方法,标引专家对计算机辅助标引结果进行定期审核检查。

2.   科技文献数据库的主题标引深度

    科技文献的主题标引深度指一篇文献标引的主题数量和专指度,数据库中每篇文献的主题词的平均标引数量。主题词太少,标引过浅,影响查全率;标引过度,主题词太多,会影响查准率。因此数据库文献要做到适度标引。标引深度每篇文献控制在8-10个主题词比较合适。

中国知网的中国医院知识仓库(CHKD)的标引实例:

这个数据库的平均标引深度为6,我认为太浅了,应该8-10个比较合适。

美国医学文献数据库(MEDLINE系统)每篇文献标引10-20个主题词,这是国际上对数据库主题词标引数量的基本要求,可以保证数据库系统良好的检索效率。

国内的科技文献数据库一般标引6-8个主题词,很多数据库没有采用主题词标引,只能用关键词、文本词检索,检索效率很难保证。

拉曼光谱法研究抗炎药、抗生素及其与DNA的相互作用Study of Anti-inflammatory Agents and Antibiotic and theInteraction with DNA by Raman Spectroscopy

【作者】 康倩倩

【导师】 周光明

【作者基本信息】西南大学分析化学, 2012硕士

【摘要】 光散射是指光线通过不均匀的介质而偏离其原来的传播方向并散开到所有方向的现象。拉曼光谱(RamanSpectroscopy)法就是利用入射光照射样品分子时,光线的方向和能量均发生改变,从而得到样品分子结构的相关信息进而实现定性检测的分析方法。当样品分子吸附于某些表面被粗糙化的金属及其氧化物或某些复合材料、半导体材料时,其拉曼信号会大大增强,这种现象称为表面增强拉曼散射(Surface-enhancedRaman Scattering),由此发展起来的分析方法称为表面增强拉曼光谱法。表面增强拉曼光谱法可以提供大量的分子振动结构信息,以此来确定吸附分子的种类、吸附取向和状态等。本文阐述了拉曼光谱的发现、原理、特点及应用;表面增强拉曼光谱的发现、增强机制及应用;采用拉曼光谱法和表面增强拉曼光谱法研究了常见的消炎药阿司匹林、阿莫西林和布洛芬及其与DNA的相互作用。研究的具体内容如下:(1)研究了SERS基底银胶的制备与后处理方法。结果表明:采用该方法制备的银胶颗粒分布均匀且稳定,通过离心提纯,浓度增大且减少了银粒子表面吸附的杂质,使样品分子更容易吸附到银粒子上从而获得更强的SERS信号。(2... 更多

Abstract Light scattering refers to the phenomenon thatlight deviates from its original propagating direction and spreads in alldirections when passes though the inhomogeneous medium. Raman spectrometry isan analytic method which can get the relevant information so as to realize thequalltative detection because of the changes of the direction and energy oflight when the incident light irradiates the sample molecules. As we all know,the phenomenon that the Raman singals of the sample molecules are o... 更多

【关键词】 拉曼光谱; 表面增强拉曼光谱; 抗炎药; 抗生素; DNA 
Key words Raman SERS Anti-inflammatoryagents Antibiotic DNA 

【中文主题词】光谱分析, 拉曼*;消炎药*;抗菌药*;阿莫西林*;阿司匹林;布洛芬

【英文主题词】SpectrumAnalysis, Raman*Anti-InflammatoryAgents*Anti-Bacterial Agents*Amoxicillin*AspirinIbuprofen

【分类号】R319.9 R978 R978.1 R978.11

【全部分类号】R319.9;R978;R978.1;R978.11;--R971.1;

【文本词】拉曼光谱;表面增强拉曼光谱;相互作用;抗炎药;抗生素;阿莫西林;阿司匹林;布洛芬;对照品;DNA双螺旋结构;吸附;碱基对;分析方法;肠溶片;缓释胶囊

·       【网络出版投稿人】西南大学【网络出版年期】2012 09

·       【被引频次】1

·       【下载频次】239

 

急性淋巴细胞白血病移植后12年继发环形铁粒幼细胞性难治性贫血1A case ofmyelodysplastic syndromes-refractory anemia with ringed sideroblasts afterhemapoietic stem cell transplantation of actue lymphoblastic leukemia 12 yearsago

【作者】 马亮亮 彭洪菊 王一 方美云

Author MA Liang-liang,PENG Hong-ju,WANG Yi,FANGMei-yun.Department of Hematology,the First Affiliated Hospital,Dalian MedicalUniversity,Dalian 116011,China

【机构】 大连医科大学第一附属医院血液科

【摘要】 1病历资料患者女,42岁。19954月因发热、乏力就诊于当地医院,诊断为急性淋巴细胞白血病L1(ALL-L1),4次化疗后完全缓解。19958月就诊于天津血液病研究所,先后予VDLP方案、大剂量的甲氨蝶呤(HD-MTX)EA方案、HD-MTX联合左旋门冬酰胺酶、依托泊苷联合6-巯基嘌呤、MOAP方案巩固化疗6次。于19964月行自体骨髓造血干细胞移植,预处理方案:左旋苯丙氨酸氮芥180mg/m2,3次口服,移植前第3;全身放疗量(TBI)10Gy,8Gy,移植前第3天。移植过程顺利,3个月后复查骨髓为完全缓解骨髓像。十余年来一般状况良好,未服用特殊药物。20082月因头晕、 

【关键词】 骨髓增生异常综合征,贫血,难治性,环形铁粒幼细胞性; 急性淋巴细胞白血病; 造血干细胞移植; 
Key words myelodysplasticsyndromes,anemia,refractory,ringedsideroblasts actuelymphoblasticleukemiahemapoieticstemcelltransplantation 

【中文主题词】贫血, 难治性*;粒细胞*;前体淋巴母细胞性白血病-淋巴瘤*;造血干细胞移植;幼红细胞;巨核细胞

【英文主题词】Anemia,Refractory*Granulocytes*Precursor Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma*Hematopoietic Stem Cell TransplantationErythroblastsMegakaryocytes

【分类号】R556.9 R331.123 R733.711

【全部分类号】R556.9;R331.123;R733.711;--R617;R331.122;R331.129;

【文本词】环形铁粒幼细胞;急性淋巴细胞白血病;难治性贫血;骨髓增生异常综合征;贫血,难治性;造血干细胞移植;移植;继发;幼红细胞;巨核细胞;血常规;骨髓涂片;骨髓像;自体造血干细胞移植;预处理

【印刷页码】86-87

·       【文献出处】 中国实用内科杂志 ,Chinese Journal of Practical Internal Medicine , 编辑部邮箱 ,200901


     
文献主题标引已经有100多年的历史,以前都是图书馆员、信息加工人员标引的。60年代有了计算机自动标引,至今自动标引质量还很不理想。

     美国的MEDLINE数据库,至今还是标引专家人工标引,但文献量大增,人工标引太慢,劳动力成本很大。中国的文献标引,想了很多办法,大多数数据库采用人工与计算机相结合的标引和分类方法,比如CNKI的中国医院知识仓库系列数据库(CHKD)、万方集团的医学数据库、中国医学科学院信息所的中国医学文献检索系统(SINOMED)等检索系统。

     文献的标引和分类质量直接影响检索效率,漏标和误标会造成漏检和误检,但标引误差难免,大家都在设法提高标引质量。

     目前,采用比较多的是建立关键词库、将关键词转化成主题词和分类号,就是自然语言与受控语言进行对应,对应是很难的,必须做到词的对应科学合理,概念准确。

     关键词库的词汇是计算机自动截词、抽词形成的,自然语言丰富,词汇的概念、语义、语句、语法、语境十分复杂,经常会有歧义,造成信息检索不准确,有些词标引的文献搞的哭笑不得,很难处理这些问题。

3.   文献主题标引质量分析

医学文献主题标引质量分析如下:

发现的问题和解决的方法:

1. 有些主题词在MESH词表和标引规则中有明确规定,不能用作主要主题词(IM词),如:急性病;危险因素

  最好将非主要主题词的主题词在词表中注明(NIM词,次要主题词),用自动标引程序控制,这样可以与主要主题词(IM词)区分开。

2.  漏标和误标问题,很难彻底解决,只有不断发现问题,补充完善词表。

标引问题实例如下:

急性白血病化疗后粒细胞缺乏患者深部真菌感染临床分析

【关键词】 急性白血病; 中性粒细胞缺乏; 真菌感染; 卡泊芬净; 两性霉素B;
【Key words】 Acuteleukemia; Neutropenia; Fungalinfection; Caspofungin; AmphotericinB;

【中文主要主题词】化疗诱发性发热性中性粒细胞减少;真菌病;急性病(不用做主要主题词)

【英文主要主题词】Chemotherapy-Induced Febrile Neutropenia;Mycoses;Acute Disease

【中文主题词】白血病(这篇文献中应是主要主题词);棘球白素;两性霉素B;专题综合分析;病人

【英文主题词】Leukemia;Echinocandins;Amphotericin B;Meta-Analysis as Topic;Patients

 

降钙素原在急性白血病化疗后中性粒细胞缺乏合并细菌感染中的临床意义

【关键词】 降钙素原; 急性白血病; 中性粒细胞缺乏; 细菌感染;
【Key words】 Procalcitonin; Acuteleukemia; Agranulocytosis; Bacterialinfection;

【中文主要主题词】化疗诱发性发热性中性粒细胞减少;革兰氏阴性菌感染;

急性病(不用做主要主题词)

【英文主要主题词】Chemotherapy-Induced Febrile Neutropenia;Gram-Negative Bacterial Infections;AcuteDisease

【中文主题词】白血病(这篇文献中应是主要主题词);降钙素(这篇文献中应是主要主题词);血清

【英文主题词】Leukemia;Calcitonin;Serum

 

糖尿病治疗中低血糖的引发因素及其护理重点

【关键词】 糖尿病、低血糖、因素、护理;

【中文主要主题词】低血糖症;危重病护理;病人(不用做主要主题词)

【英文主要主题词】Hypoglycemia;CriticalCare Nursing;Patients

【中文主题词】糖尿病(这篇文献中应是主要主题词);护理工作;护理记录;护理方法学研究;生命体征

【英文主题词】Diabetes Mellitus;NursingServices;Nursing Records;NursingMethodology Research;Vital Signs

 

标引质量评价指标:

漏标率  

误标率  

准确率  

标引质量良好的实例:

HPLC法测定盐酸左旋沙丁胺醇缓释胶囊的有关物质Analysis oflevalbuterol hydrochloride sustained release capsules by RP-HPLC

【作者】 齐潇潇 邓红 林华庆 张蜀 余楚钦

Author QI Xiao-xiao,DENG Hong,LIN Hua-qing,ZHANG Shu and YUChu-qin(Institute of Meteria Medica,Guangdong Pharmaceutical College,Key Laboratoryof Advanced Drug Delivery of Guangdong Province,Guangzhou,Guangdong510006,China)

【机构】 广东药学院药物研究所/广东药物新剂型重点实验室

【摘要】 目的测定盐酸左旋沙丁胺醇缓释胶囊的有关物质。方法采用反相高效液相色谱法(RP-HPLC),色谱柱为Kromasil C18(250 mm×4.6 mm,5μm),以甲醇-磷酸盐缓冲液(取磷酸二氢钠9.77 g,加水溶解并稀释至1 000 mL,用磷酸调节pH值至3.10±0.05)(体积比2080)为流动相,检测波长为224 nm,流速1.0 mL.min-1。结果各杂质峰分离良好,左旋沙丁胺醇的最低检测限为14 ng。结论本法可用于盐酸左旋沙丁胺醇缓释胶囊中有关物质的检测。 

Abstract Objective To establish an HPLC method for analyzinglevalbuterol hydrochloride sustained-release capsules.Methods Samples wereanalyzed on a Kromasil-column(250 mm×4.6 mm,5 μm).The mobile phase consisted ofmethanol-PBS(9.77 g sodium dihydrogen phosphate in 1 L of water,adjusted to pH3.10±0.05 with phosphoric acid)(2080).Thedetection wavelength was 224 nm and the flow rate 1.0 mL·min-1.ResultsImpurities were separated well from each other,and the detection limit oflevalbuterol hydrochloride... 更多

【关键词】 盐酸左旋沙丁胺醇; 缓释胶囊; 有关物质; 高效液相色谱法; 
Key words levalbuterohydrochloride sustained-releasecapsules RP-HPLC 

【中文主要主题词】左沙丁胺醇;迟效制剂;胶囊

【英文主要主题词】LevalbuterolDelayed-Action PreparationsCapsules

【中文主题词】色谱法, 高压液相;色谱法, 反相;检测极限;磷酸盐类

【英文主题词】Chromatography, HighPressure LiquidChromatography, Reverse-PhaseLimit of DetectionPhosphates

【分类号】R971.93;R944.9;R944.5;

【全部分类号】R971.93;R944.9;R944.5;--R446.1;R181.2;R916.3;

【基金】 2006年广州市科技计划项目(2006Z3-E406)

【文本词】盐酸左旋沙丁胺醇;缓释胶囊;HPLC法测定;物质;高效液相色谱法;左旋沙丁胺醇;反相高效液相色谱法;检测限;磷酸二氢钠;HPLC

【文献出处】 广东药学院学报 ,Journal ofGuangdong Pharmaceutical College , 编辑部邮箱 ,200901

 

手性高效液相色谱法测定盐酸左旋沙丁胺醇缓释片含量及其右旋体

【作者】 邓红 林华庆 张蜀 许良葵 余楚钦

【机构】 广东药学院药物研究所,广东省药物新剂型重点实验室

【摘要】 目的:建立手性高效液相色谱法测定盐酸左旋沙丁胺醇缓释片的含量及右旋异构体。方法:采用Chirex(S)-ICA(R)-NEA手性柱,以正己烷-二氯甲烷-甲醇-三氟醋酸(240140201)为流动相,流速为1.0mL.min-1,检测波长为278nm。结果:盐酸左旋沙丁胺醇与其右旋体分离度良好,0.061680.6168g.L-1范围内与峰面积线性关系良好,(r=0.9991),平均回收率为99.6%;最低检测限为12ng。结论:所建立的方法可用于该制剂的质量控制。 

【关键词】 盐酸左旋沙丁胺醇; 缓释片; 含量测定; 高效液相色谱法; 手性; 

【中文主要主题词】左沙丁胺醇;色谱法, 高压液相;迟效制剂

【英文主要主题词】LevalbuterolChromatography, High Pressure LiquidDelayed-ActionPreparations

【中文主题词】立体异构现象;质量控制;硬化溶液;二氯甲烷;己烷类;回收率

【英文主题词】StereoisomerismQuality ControlSclerosing SolutionsMethylene ChlorideHexanesRetrieving Rate

【分类号】R971.93;R446.1;R944.9;

【全部分类号】R971.93;R446.1;R944.9;--R-05;R19;R944.1;R916.4;R284.21;

【基金】 2006年广州市科技计划项目(编号:2006Z3-E406)

【文本词】盐酸左旋沙丁胺醇;高效液相色谱法测定;缓释片;高效液相色谱法;右旋异构体;质量控制;三氟醋酸;二氯甲烷;正己烷;平均回收率

【文献出处】 中国医院药学杂志 ,Chinese Journalof Hospital Pharmacy , 编辑部邮箱 ,200913

 

24例功能区胶质瘤手术神经生理监测的意义

【作者】 马书伟 郑广顺 栾晓祖

【机构】 福建省厦门市第二医院神经外科

【摘要】 目的评估功能区胶质瘤术中神经电生理监测(IONM)的意义。方法选择20067月至20085月该院收治经影像学诊断确诊的胶质瘤患者48,随机分成两组,每组24例。A组手术在没有IONM的条件下进行;B组患者术中联合应用体感诱发电位(SEP)和直接皮层单极电刺激定位中央区,比较两组患者的肿瘤切除程度、生存时间、术前和术后的Karnofsky评分及运动功能。结果 A组肿瘤全切19(79.2%)、次全切5(20.8%),B组肿瘤全切18(75.0%)、次全切6(25.0)。结论功能区的胶质瘤手术时行IONM能够增加手术安全性。IONM对生存时间和切除程度没有影响。 

【关键词】 电生理学; 神经生理学; 经皮神经电刺激; 神经胶质瘤; 诱发电位,躯体感觉; 功能皮质区; 

【中文主要主题词】神经胶质瘤;术中神经生理监测;诱发电位, 躯体感觉

【英文主要主题词】GliomaIntraoperative Neurophysiological MonitoringEvoked Potentials,Somatosensory

【中文主题词】经皮神经电刺激;神经生理学;电生理学

【英文主题词】TranscutaneousElectric Nerve StimulationNeurophysiologyElectrophysiology

【分类号】R730.264;R61;R338.8;

【全部分类号】R730.264;R61;R338.8;--R454.1;R338;R33;R35;

【文本词】胶质瘤;神经生理监测;术中神经电生理监测;诱发电位,躯体感觉;手术;经皮神经电刺激;神经生理学;神经胶质瘤;电生理学;功能

【文献出处】 重庆医学 ,ChongqingMedicine , 编辑部邮箱 ,201214

 

4.   对主题标引规则的正确理解和应用

 

PUBMED医学文献数据库主题标引规则 (3)

2013-7-17 15:22

全文 PubMed标引规则马小姐译_20130703.doc 许老师审校.doc PUBMED医学文献数据库主题标引规则(1)http://blog.sciencenet.cn/blog-280034-707407.html PUBMED医学文献数据库主题标引规则 (2) http://blog.sciencenet.cn/blog-280034-708640.htmlMeSH Headings/Tree MeSH 主题词 ...

个人分类: 知识组织|1705次阅读|没有评论

 

PUBMED医学文献数据库主题标引的原理与原则 (2)

2013-7-16 16:08

PUBMED医学文献数据库主题标引的原理与原则(1)http://blog.sciencenet.cn/blog-280034-707407.html Check tags 特征词 Virtually every biomedical article will describesubjects of research (human or animal; mice or rats, etc). Clinical articleswill describe treatment, diagnosis, e ...

个人分类: 知识组织|1240次阅读|没有评论

 

PUBMED医学文献数据库主题标引的原理与原则(1)

2013-7-12 10:53

马小姐译,许培扬校红字是我校改的,大家可以参考。 The IndexingProcess 标引过程 Read carefully and understand thetitle. 仔细地阅读并理解文献的标题。 Read theintroduction down to the point where the author states the purpose of hisarticle and correlate ...

个人分类: 知识组织|1754次阅读|没有评论

许培扬科学网博客  主题标引规则http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=280034&do=blog&view=me&classid=114878&from=space&page=3

5.    怎样标引医学论文的主题词
论文的关键词,主题词标引也是麻烦的事情,谁来标引呢?作者标引,编者标引,信息专业人员标引都是可以的。

主题标引是知识组织与管理的最基本方法和要求,科技人员都要掌握。主题词是最基本的知识单元,在信息获取和交流中起到极其重要的作用。

国内SINOMEDCHKD、日本的医学数据库、美国的MEDLINE、欧洲的EMBASE都是用主题词表组织和控制数据库的文献信息的。

怎样标引医学论文的主题词 

请见http://blog.sciencenet.cn/blog-280034-249520.html

 




http://blog.sciencenet.cn/blog-280034-963256.html

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