形而上学的核心任务是认识本体，而且是超验的本体。那么首先需要解决的问题是，我们能否认识它？如果能，如何说明？
首先说明对笛卡尔而言，有哪些实体？
笛卡尔从普遍怀疑开始他对实体的研究。他发现除了"我在怀疑"这一当下的事实之外，一切都可以怀疑，所以，他提出"我斯故我在"，这是他哲学体系的第一原理。
笛卡尔的"我"，即我赖以成为我的那个心灵，所以，笛卡尔首先得到了心灵这一精神实体的存在；
在确定精神实体之后，笛卡尔进一步思考是否还在其他实体。他认为，我能清楚明白地领会到无限完满的观念，而一个怀疑着的因而不完满的我不可能是这种无限完满观念的原因，必然有某种无限完满的存在是它的原因，并把它放在我的心里，这个原因就是上帝。在笛卡尔看来，上帝是我心中的观念的原因，也是我存在的原因。这样一来，笛卡尔得到了上帝这个实体；
接下来，既然上帝存在，那么，凡我心中清楚明白地领会到的真观念皆来自上帝，同时无限完满的上帝不可能骗人，因此他赋予我的有关物质实体的观念必然为真即必然真实存在。这样，笛卡尔在上帝的保证下肯定了物质实体的存在。
综上，笛卡尔从"我思"出发，建立了他的本体世界，包括上帝，精神实体（心灵）和物质实体（自然）。


接下来，我们需要了解，笛卡尔是如何保证精神实体与物质实体的统一性的，也就是认识论的关键问题，世界可否被认识？
笛卡尔看来，精神实体与物质实体本质属性不同，它们之间毫不相关，没有任何联系和相互作用，更无任何统一性，这就是他的二元论。那么，世界如何被认识呢？
笛卡尔有两个方式来寻求这种统一性。
第一，他认为，只有一种实体不需要别的事物的存在而能存在，那就是上帝。他把上帝称为绝对实体，把物质和精神实体称为相对实体。绝对实体是全智，全能，全善的，它不仅仅是两个相对实体存在的根据，也是两者相统一的根据。他认为，上帝一方面把这些规律（即统一性）建立在自然之中，一方面又把它们的概念印入我们的心灵之中。而我们相信上帝的理由是，"上帝不是骗子"，"我们的信仰的全部可靠性就取决于这一点"。正是借助上帝的保证，我们才能统一思维与存在，精神与物质，心灵与实体。
第二，笛卡尔作为处在科学昌盛的时代的科学家，试图为这种统一性寻找某种"科学"的解释，也就是在上帝之外，寻找突破口，来论证物质与精神实体的统一性。这就是他的"身心交感说"（我依然记得大一那年在图书馆看到他的这个提法，让我异常的兴奋，触电一般）。笛卡尔的"身心交感说"说的是，大脑中有一个小松果腺，灵魂在这里比在其他部分更专门的施行它的功能。这个小松果腺是圆锥形的（我不知道笛卡尔为什么认为是圆锥形），它是灵魂的居住处，也是心灵能施展自己功能，从而使身心发生交感的中介。正是通过这个中介，心灵可以作用于身体，使身体产生运动，身体也可以作用于心灵，引起心灵的思想。
在论证了思维与存在的统一性，也就是保证了知识的客观有效性的前提下，笛卡尔试图建立绝对确定的知识体系。
笛卡尔否认真理性的知识来源于感性，那么这种知识只能是天生的，这就是他的"天赋观念论"。
首先，笛卡尔把观念分为三类:（1）与生俱来的观念（2）来自外界的观念（3）由我造成和生造的观念。在他看来，（3）肯定不能提供可靠的知识，（2）也不能，因为（2）知识往往由感官获得，而感官常常欺骗我们，例如筷子插入水中。因此，只有（1）才能提供可靠的知识，而要达到这种观念，就必须把自己的心智提高到感性事物之外，专注于自己的心灵。哪些是笛卡尔所谓的天赋观念的知识呢？其中有"我思"，"实体"，逻辑中的"同一律"，"排中虑"，还有"我思故我在"这一他的哲学的第一原理。
笛卡尔获取天赋观念之外的知识的唯一方法是理性演绎法，所以他认为可靠的知识是"理性的光辉所产生的"。
在笛卡尔看来，感性归纳是没有地位的。因为他认为，来自外界的观念"不是一种可靠的，经过深思熟虑的判断，而仅仅是一种盲目的，鲁莽的冲动下得出来的"，这是错误的根源。
到此，总结完毕近代唯理论和近代理性演绎法的奠基者，笛卡尔的认识论。
（不得不承认，有很多地方可以攻击，但是这是人类史上最初的努力，而且非常明显，逻辑性极强，雄心勃勃，最重要的是，提供了第一个唯理论认识论的框架，做过偏理论研究的人都深有体会，这是最困难的，也最需要想象力的，不愧为笛卡尔，近代哲学之父。第一个试图联系代数与几何的数学家。我们必须明白，很多东西我们并不真正理解，不过是熟悉罢了，让我们以为我们理解了）