项目描述：

此次参与的EOL鲁宾斯坦伙伴计划的项目内容是“利用EOL已经收集的生物分类树(名录)进行比较分析，计算各种分类系统之间的重叠与差异的程度”。生物分类名录在生物多样性研究及生物分类等领域都有重要的作用。各种不同分类系统的出现主要是由于:

1. 分类学家对同一生物类群有不同的分类观点

2. 分类手段如分子系统学等对传统分类体系的修正

3. 新物种或标本的发现引起对旧分类系统的修正

4. 生物分类名录的地域局限性

因此,进行生物分类名录的比较有迫切必要性,也是生物多样性信息学研究的重要内容之一。目前EOL已经收集将近20个分类名录，各名录所覆盖的类群、区域、采用的分类体系都不尽一致，因此提出对这些名录进行分析。考虑到名录比较分析具有长期持续意义，本项目将实现一个生物名录的比较工具Taxonomic Hierarchy Comparator (THC)，并将拓展项目的内容，使用户能够使用该工具将自己的名录与EOL的所有名录进行比较。

THC的潜在用户：

生物多样性信息学研究者：分析名录差异，查找数据间隙（gap），建立名录间关联。

生物分类学家：发现自己的分类观点与他人的差异与相同之处。

主要功能需求：

1、用户管理：用于用户的注册、授权、信息更新等，也便于用户相关分析实验结果的保存和共享。

2、分类名录管理：

a. 创建名录: 从EOL的Web API获取；用户上传xml创建等。

b. 共享名录：与指定的其他用户共享自己的名录

c. 导出名录：保存为标准格式xml文件或excel

d. 编辑名录：新增、修改名录中阶元

3、分析实验：

a. 创建实验：提供实验标识；选择要比较的名录

b. 执行：采用任务队列执行，因为过程比较耗时

c. 可视化：对结果进行可视化展示，可直观看出名录差异

d. 计算：进行交集和差运算，提取相同与不同的地方

本文摘录自《THC的需求分析》

作者：林聪田，2013 EOL Rubenstein Fellow