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2021年3月30日,中国科学院生物物理研究所叶克穷研究员团队在Nucleic Acids Research杂志发表了题为Profiling of RNA ribose methylation in Arabidopsis thaliana的研究论文,文章全面分析了模式植物拟南芥中rRNA和snRNA的2'-O-甲基化核苷酸(Nm)修饰图谱。
真核生物rRNA 和snRNA 具有丰富的2'-O-甲基化核苷酸(Nm) 修饰,这些修饰主要由box C/D snoRNA 引导的酶介导合成的。在模型植物拟南芥中,C/D snoRNAs 已经进行了很好的分类,但是缺乏对Nm的系统性的研究。
本研究应用RiboMeth-seq 来分析胞质,叶绿体和线粒体rRNA 和snRNA 中的Nm。本研究在细胞质rRNA 中鉴定出111 个Nm,在snRNA 中鉴定出19 个Nm,并使用最新的snoRNA 列表为大多数检测到的位点做了分配。与酵母中一样,至少四个位点由具有多重特异性的向导介导。研究发现C/D snoRNAs 经常与甲基化位点附近的序列形成额外配对,这可能有助于底物结合。叶绿体和线粒体rRNA 包含五个几乎相同的甲基化位点,包括两个介导核糖体亚基连接的新位点。FIB1或FIB2基因的缺失减少了C/D snoRNA 的积累和rRNA 的甲基化,其中FIB1 在甲基化中起更大作用。
RiboMeth-seq analysis of Arabidopsis cytoplasmic rRNAs
综上,本研究报道了拟南芥rRNA和snRNA全面的Nm图谱,这对其功能和生物合成的研究具有推动作用。
文章链接:https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkab196/6204644
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