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生活点滴| Linux| 统计学与R语言学习| 生物信息学与计算生物学| 流行病学建模| 论文写作| matlab|

偏相关系数: 热度 5 彭友松 2010-10-21 21:52; 在多元相关分析中，简单相关系数可能不能够真实的反映出变量X和Y之间的相关性，因为变量之间的关系很复杂，它们可能受到不止一个变量的影响。这个时候偏相关系数是一个更好的选择。偏相关系数是在排除了其他变量的影响下计算变量间的相关系数。假设我们需要计算X和Y之间的相关性，Z代表其他所有的变量，X和Y的偏相关系 ...; 个人分类: 统计学与R语言学习|31388 次阅读|6 个评论热度 5

ridge regression: 热度 2 彭友松 2010-10-20 23:02; ridgeregression可以用来处理下面两类问题：一是数据点少于变量个数；二是变量间存在共线性。当变量间存在共线性的时候，最小二乘回归得到的系数不稳定，方差很大。这是因为系数矩阵X与它的转置矩阵相乘得到的矩阵不能求得其逆矩阵，而ridgeregression通过引入参数lambda，使得该问题得到解决。在R语言中，M ...; 个人分类: 统计学与R语言学习|21850 次阅读|1 个评论热度 2

学习笔记-主成分分析和主成分回归: 彭友松 2010-10-20 22:41; 主成份分析是对数据降维的方法，通过从数据中抽提少数的主成份来近似代表数据。选择主成份是根据数据的方差来进行的，每次选择的主成份都是数据中方差最大的方向，并且主成份之间不相关。求主成份的两种方法： 1从变量构成的矩阵X出发，先求出t(X)X的特征值和特征向量，然后用X乘以特征向量就得到了主成份 ...; 个人分类: 统计学与R语言学习|13205 次阅读|没有评论

在R中如何求给定分布和统计量的p-value: 彭友松 2010-3-24 10:58; 在知道了分布函数和相应的统计量后怎样得到p-value呢?用R可以很容易的实现,如下(来自统计建模和R软件) P_value-function(cdf,x,paramet,side=0){ n-length(paramet) p-switch(n+1, ...; 个人分类: 统计学与R语言学习|30991 次阅读|2 个评论

线性回归的假设和pearson相关系数的假设: 彭友松 2010-3-17 15:07; pearson相关系数是最经常使用的相关系数,一般情况下我们会毫不犹豫的选择它,而大部分情况下都没有考虑到数据是否符合它的假设,如下所示: 1 两个变量间有线性关系 2 变量是连续变量 3 变量均符合正态分布,且二元分布也符合正态分布 4 两变量独立第一个假设是必须的,虽然有很多主观的因素在里面,但一般从散点图上能够大致看 ...; 个人分类: 统计学与R语言学习|14576 次阅读|1 个评论

confidence interval & prediction interval & tolerance interval: 彭友松 2010-1-18 17:05; 简单的解释: confidence interval 是指估计的总体参数的可信度区间, 如总体均值,总体方差等; prediction interval是指对于单个点估计的可信度区间. 详细的说明见: http://www.cee.vt.edu/ewr/environmental/teach/smprimer/intervals/interval.html Confidence Intervals Ty ...; 个人分类: 统计学与R语言学习|12760 次阅读|没有评论

R中包含约束的线性回归: 彭友松 2010-1-12 21:50; 有一个应变量Y和几个自变量X,现在需要对Y和X进行多元回归,但是对于X有约束,这个问题应该怎样做? 如果没有约束,那么可以直接用lm()函数进行,但是如果有约束该怎么办? 无约束的线性回归的原理在于使得实际值和估计值间的差值总和最小,如果有约束的话,自变量的系数取值空间是有限制的,这其实是对应规划问题.R中的约束线性规划 ...; 个人分类: 统计学与R语言学习|12521 次阅读|没有评论

R中不包含常数项的回归: 彭友松 2009-11-20 09:59; 最近在重复一篇文章的做法的时候发现多元回归方程是否包含常数项对回归方程影响很大，不太理解，于是到处寻找资料终于发现了原因。回归不包含常数项实际上就是强制通过原点，使得常数项为0。一般的情况下，实际数据得到的回归直线一般都有一个通过Y轴的截距，即常数项。如果强制它为0,实际上就是使得直线在Y轴的截距为0,这 ...; 个人分类: 统计学与R语言学习|24110 次阅读|没有评论

perl中如何调用R语言: 热度 1 彭友松 2009-11-19 14:15; 以下是从网上收集的从perl中调用R的方法： 1 直接用system（）命令比如有个test.R程序，可以通过下面的方式调用： system(R test.R --vanilla) 2 安装模块RSperl 该模块的具体介绍http://www.omegahat.org/RSPerl/ 安装过程如下： tar zxf RSPerl_0.9-0.tar.gz R CMD INSTALL --configure-args=' ...; 个人分类: 统计学与R语言学习|21110 次阅读|没有评论热度 1

R语言中的机器学习: 热度 1 彭友松 2009-11-18 10:53; 转载自 R中文论坛(http://rbbs.biosino.org/Rbbs/posts/list/192.page) Machine Learning Statistical Learning （机器学习统计学习）网址： http://cran.r-project.org/web/views/MachineLearning.html 维护人员：Torsten Hothorn 版本：2008-02-18 18:19:21 翻译：R-fox, 2008-03-18 ...; 个人分类: 统计学与R语言学习|9897 次阅读|2 个评论热度 1

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