科学网—bioysy的博文

水稻代谢组的QTL作图

闫双勇 2012-1-12 00:51

Dissection of genotype-phenotype associations in rice grains using metabolome quantitative trait loci analysis http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1365-313X.2012.04903.x/pdf 这是我看到的第1篇将代谢组作为一种表型进行QTL作图的报道.感觉这篇文章用的群体小了点,81个回交重组 ...

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精细定位"精细"的意思

闫双勇 2011-6-29 22:38

目前植物的基因/QTL图位克隆,一般是两个步骤:粗定位和精细定位.精细定位的"精细"有两个含义:1 特定区间的高密度标记 2 特定区间足够多的重组.这二者缺一不可.没有标记无法前进,没有重组,再多的标记也没用,因为分子标记和目标基因的距离是通过重组来衡量的.要获得高密度的标记,当然最好是序列已知 ...

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数量性状的分类

热度 1 闫双勇 2011-3-28 11:08

QTL作图,研究的对象是数量性状.不同的数量性状作图方法有差异.按徐老师的书中分为下列几类 1 可以进一步分解为不同组分的性状,如产量性状 2 相关性状 3 质量-数量性状(Qualitative–quantitative traits) 许多经济重要性状，例如株高、抗虫、抗病性及种子质量等，在植物群体中表现为主基因和多 ...

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QTL作图基本问题

闫双勇 2011-3-27 16:15

文章的标题是这个帖子的主题,是因为这篇文章勾引的 1 A simple method for calculating the statistical power for detecting a QTL located in a marker interval 文章摘要部分特别提到:This method allows us to answer one of the fundamental questions in designing a QTL mapping experiment: What is the mi ...

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Fine mapping QTL selective phenotyping strategies LD AND LA

闫双勇 2011-3-27 15:48

文章完整标题是: Fine mapping quantitative trait loci under selective phenotyping strategies based on linkage and linkage disequilibrium criteria j.1439-0388.2009.00813.x.pdf 这个标题全是我赶兴趣的关键词:比如Fine mapping quantitative trait loci/selective phenotyping/linkage and linkage&nb ...

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QTL作图时亲本间存在表型差异不是必须的

热度 5 闫双勇 2011-3-25 09:51

在大多数例子中，亲本间没有表型差异但仍能检测到 QTL ，这可能是由于阳性和阴性 QTL 的互补效应。 QTL 作图能提供作图群体中的遗传组份分离的信息，所以可以鉴定具有不同 QTL 等位基因组合的单株 , 确定理想基因型的单株。例如，如果 4 个 QTL 控制一个性状 , 可以确定所有个体每个 QTL 等位基因的组成 , 很容易检 ...

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作图新动向

闫双勇 2011-3-25 08:41

纯个人意见: 1 同时利用多个群体进行一个性状的作图 2 连锁和关联作图方法结合 3 高通量基因型鉴定 4 直接精细定位QTL

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建立近等基因系的方法

热度 1 闫双勇 2011-3-16 11:34

这是徐老师书里总结的: 1 多代回交其它方法: 2 来自于自交的近等基因系。通过持续的自交保持目标性状位点的杂合可以建立成对的近等基因系。一旦其它遗传位点几乎已经稳定 , 自交将产生在目标位点有差异的成对近等基因系 (Xu and Zhu, 1994) 。来源于自交的近等基因系 ...

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建立QTL近等基因系的快速方法

热度 1 闫双勇 2011-2-26 23:25

Quantitative Trait Locus (QTL) Isogenic Recombinant Analysis: A Method for High-Resolution Mapping of QTL Within a Single Population Quantitative Trait Locus (QTL) Isogenic Recombinant Analysis.pdf 当然,是不是有效,试了才知道.这种方法还用得比较少.的确有它的优点.总得有人去尝试.虽然是05年 ...

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QTL精细定位随想

热度 1 闫双勇 2011-2-20 00:37

随想的意思就是,随便想想,这是一个让人比较感兴趣的领域.目前对这个领域促进最大的技术或方法有两个:一是高通量测序,二是关联作图在植物中的应用. QTL精细定位.是核心内容.精细定位后可以直接进行分子标记辅助育种,进一步是克隆QTL控制基因. &nbs ...

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