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Cairo 中的文字渲染模型
黎瑞源 2010-7-23 23:13
图示,Cairo中的文字的图形模型在 http://cairographics.org/tutorial/ 有比较详细的说明,最近因为需要,根据这个说明做了更详细的图示说明。 在select_font_face(font_family,slant,weight)中可用的一般有字体有:serif, sans-serif, cursive, fantasy, monospace等标准CSS2的一般性字 ...
个人分类: R|5251 次阅读|没有评论
用Cairo做R语言的图形渲染的库
黎瑞源 2010-7-3 22:23
R语言是一个开源的很优秀的用于统计软件包,我还是非常喜欢的。最近发现了一个在R中基于Cairo进行图形绘制的库,http://www.rforge.net/Cairo/files 。 Cairo是一个很优秀的2D图形API(http://cairographics.org/),这里是Cairo的历史等(Cairo: A Graphic Novel:http://forum.newsarama.com/showthread.php?t=135035), ...
个人分类: R|8664 次阅读|没有评论
基于石墨单分子层纳米孔的测序技术
黎瑞源 2010-6-3 00:33
我们知道,组成DNA序列的4种碱基有着不同的带电性质,如果能直接一一测量DNA链上每一碱基的带电性质,哪也就可以知道了DNA的序列了。一个很好的办法就是,用一块很薄的材料,然后在上面开一个很小的孔,测量通过小孔的电流(这个电流是恒定的),然后再测量当一个一段DNA序列通过这个小孔时的电流变化情况,通过电流的变化 ...
个人分类: next-generation-sequence|6079 次阅读|2 个评论
EMMAX- efficient mixed-model association
黎瑞源 2010-5-26 23:23
最近,nature Genetics发表了一篇文章,文章主要介绍了利用一种新的工具软件进行全基因组关联分析的结果。EMMAX是一种进行关联分析的新方法,这种方法非常高效:平常需要几年才能完成的计算量,EMMAX只要几个小时就可以完成。他处理群体结构的方法与一般的软件不一样。看来,关联分析又有一场新的革命了。 Variance ...
个人分类: genetic association breeding|10752 次阅读|没有评论
今天听关于关联分析和在作物育种中应用的一点总结
热度 2 黎瑞源 2010-5-17 20:56
,听了一个从CIMMYT回来的师兄的报告,题目是关联分析在作物遗传改良中的应用。觉得很有意思,在这里记录一下,与大家分享,可能某些观点和看法因为不能很好的理解从而记录有误,还请大家多担待。 首先介绍了目前国际作物育种所面临的新任务-哪就是解决世界人们的粮食需求,保证人们的温饱,并且提到:上一辈的育种家已 ...
个人分类: genetic association breeding|9483 次阅读|2 个评论 热度 2
re-sequence需要多高的覆盖度
黎瑞源 2010-5-6 18:55
今天听报告,里面有一个内容就是通过re-sequence的方法来找到相关性状的候选基因。连续到这一段时间以来,发现有很多关于重测序利用的报道,不由的想到了这个问题,那就是: 要达到我们的目的,re-sequence需要达到多大的覆盖度? 初步思考,认为与下面的内容相关: (1)物种基因组结构的复杂程度,比如说像油菜这一 ...
个人分类: next-generation-sequence|7367 次阅读|没有评论

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