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Antibody from WIKIpedia zz
袁曙光 2010-1-8 03:56
From Wikipedia, the free encyclopedia Jump to: navigation , search Immunoglobulin redirects here. For the immunoglobulin family, see Immunoglobulin superfamily . Each antibody binds to a specific antigen; an interaction similar to a lock and ...
个人分类: 好文转载|13356 次阅读|没有评论
SSH and SCP
袁曙光 2010-1-7 22:16
ssh scp 用法 对于没有开通FTP服务器的机器,scp结合ssh对于我们远程工作非常方便。 ssh远程登录: ssh root@192.168.1.101 如果想支持图形界面,命令则为: ssh -X root@192.168.1.101 输入用户名密码后, 再新开一个shell脚本 用于查看远程机器的目录以及文件 然后scp拷贝文件: scp root@ ...
个人分类: Linux相关|4497 次阅读|2 个评论
Schrodinger 功能模块简介 zz
袁曙光 2010-1-7 15:57
http://www.schrodinger.com Schrdinger(薛定谔)是药物发现的完整软件包,包括:基于受体和配体结构的诱导契合和柔性对接模式;基于受体结构及配体极性的对接模式;基于受体结构及溶液环境性质的对接模式;组合化学库设计及基于组合库的对接模式;基于配体结构的药物设计,药效团和3D-QSAR;生物分子结构模拟 ...
个人分类: 好文转载|13527 次阅读|没有评论
模拟平台,你选哪个?
袁曙光 2010-1-6 03:10
良好的平台,对于做计算而言是不可或缺的条件。所谓良好主要有两方面:一是稳定;二是能很好地支持当前的主流计算软件。目前,几乎所有的模拟软件支持平台最全面的还属Linux,其次是苹果和Unix但相比之下没有Linux全面。而对于专门做计算的专业人员来讲,一般是不大会考虑 ...
个人分类: Linux相关|6947 次阅读|2 个评论
Protein-Protein Docking Summary and Tools
热度 1 袁曙光 2010-1-1 17:09
Wiki about Protein Docking Macromolecular docking From Wikipedia, the free encyclopedia Jump to: navigation , search Macromolecular docking is the computational modelling of the quaternary structure of complexes formed by two or more interac ...
个人分类: 好文转载|22767 次阅读|3 个评论 热度 1
Gift for New Year
袁曙光 2009-12-26 16:01
自己动手用前两天拍的照片做了个card,作为节日礼物送给各位同仁,祝大家新的一年身心健康,学业、事业有成。
个人分类: 未分类|3721 次阅读|1 个评论
Linux常用命令一览
袁曙光 2009-12-26 02:02
su   su命令是最基本的命令之一,常用于不同用户间切换。例如,如果登录为 user1,要切换为user2,只要用如下命令:   $su user2   然后系统提示输入user2口令,输入正确的口令之后就可以切换到user2。完成之后就可以用exit命令返回到user1。   su命令的常见用法是变成根用户或超级用户。如果发出不带用户名 ...
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模型的侧链优化策略
袁曙光 2009-12-25 23:14
以前对这个问题比较困惑,现在我的观点是(针对docking): 1. 如果要做对接的蛋白是来自已经发表的PDB 尤其是分辨率比较好的PDB文件,没有必要做什么侧链优化。一般X-ray的结构就是它蛋白的真实结构,特别是对分辨率比较好的PDB文件。如果要优化,能优化出什么来呢?难道比真实结构更真实?who believe. 而且:如果对 ...
个人分类: 科研笔记|6228 次阅读|1 个评论

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