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MengnanWang

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候选基因法: 王梦南 2021-9-10 11:06; 在生物学科刚起步发展时，限于生物技术的原因，我们无法对基因组进行大规模的测序及基因鉴定。因此，我们在进行表型研究时，常采用候选基因法，即：寻找相关基因进行功能的验证。随着生物学技术的发展，大规模的基因组测序已经成为可能。 ...; 3970 次阅读|没有评论

冒泡排序与选择排序: 王梦南 2021-9-9 10:07; 冒泡排序与选择排序主要区别在于交换的方式不同，冒泡排序是通过相邻元素的比较进行交换，而选择排序则是通过当前元素与第n个元素的比较进行交换。; 1689 次阅读|没有评论

创造性科学问题与创新性科学问题: 王梦南 2021-9-3 12:44; 科学问题大致可以分为两种，一种是创造性科学问题，一种是创新性科学问题。什么是创造性科学问题，创造性的科学问题聚焦于一个领域甚至是一个科学的问题，拿我们的生物学科举例，基因敲除技术解决的就是一个创造性的问题，基因敲除技术推 ...; 1861 次阅读|没有评论

python 爬虫: 王梦南 2021-7-14 16:35; 目前python主流的爬虫包为requests与urllib，但是requests包在访问网页时经常报错，原因也没有完全解决，根据查询应该是requests包不支持https访问。 urllib在获取网站源代码时，需要解析网页代码，一般是html或者css。在解析网页时，需要 ...; 1797 次阅读|没有评论

kEGG中符号的内涵: 王梦南 2021-7-9 13:11; 实线箭头：1.一步生化反应 2.正向调控 3.分子相互作用虚线箭头：1.间接反应 2.不确定的生化反应 KO代表某一类同源基因，ko代表通路的编号 org:表示物种 ...; 5734 次阅读|没有评论

IGV使用教程: 王梦南 2021-7-2 10:10; IGV（The intergrative Genomics Viewer）是生物信息学中常用的结果可视化软件。我们在使用bwa或者bowtie2将转录组测序文件比对到参考基因组上获得sam文件后，需要将sam文件通过samtools软件转为bam文件。bam文件为二进制文件，里面包含了测序文件比对到参考基因组上的信息。 &nbs ...; 8135 次阅读|没有评论

群体进化中的选择消除分析: 王梦南 2021-6-29 19:37; 在基因组的研究中，当某一位点发生强突变时，由于连锁的存在使得该强突变位点及其相邻的位点，同时出现的概率增加，从而降低了强突变位点附近单倍型的多态性，增加了该强突变位点及相邻位点单倍型出现的概率。这就是我们所说的选择消除。; 2677 次阅读|没有评论

linux并行运算: 王梦南 2021-6-28 23:10; 可以将任务挂到后台运行; 1295 次阅读|没有评论

linux文本处理工具sed: 王梦南 2021-6-15 17:30; sed与grep，awk统称为linux三剑客，sed主要是文本的流编辑器，所谓流编辑器是指sed能够通过管道符进行结果的接受与编辑，其功能主要是选取，替换，删除，新增等命令。 sed语法格式：sed -选项操作 file &n ...; 1852 次阅读|没有评论

linux文本处理工具awk: 王梦南 2021-6-15 17:02; 我们知道grep与sed工具主要是针对行操作，awk是linux系统中，针对文件列处理的工具。 awk的语法结构为：awk ' 条件1{操作1} 条件2{操作2}......' awk中有一些特殊的模块：BEGIN，NF，FS，NR BEGIN模块为：awk命令前的声明模块，例如： awk 'BEGIN{FS=:} pri ...; 个人分类: linux|1836 次阅读|没有评论

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