我们知道三代基因组测序，具有长读长的优点。wtdbg2软件，采用De Bruijn算法。在进行三代测序基因组组装时，wtdbg2软件首先将长片段打断为1000bp左右的reads，在计算时软件将reads继续打断为长度为0-25bp长度的k-mer(也就是-k，-p选项的参数设置)。

        比如：现有ATCGATCG序列，若设置k=5，则会生成ATCGA，TCGAT，CGATC，GATCG四条k-mer，通过k-mer间的重合，最终得到contigs。因此，-k选项，可以更根据测序深度，与测序质量的高低进行调高或调低。-e选项则为reads重合片段的最小测序深度（edge overlap depth）。如-e=5时，边缘的重合深度小于5时则舍弃此overlap。