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Alpha多样性
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2021-1-12 00:33
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Alpha多样性(样本内多样性) Alpha多样性是指一个特定区域或者生态系统内的多样性, 常用的度量指标有Chao1 丰富度估计量(Chao1 richness estimator) 、 香农多样性指数(Shannon diversity index)、 辛普森多样性指数(Simpson diversity index)等。 计算菌群丰度:Chao; 计算菌群多样性 ...
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个人分类: qiime2|14535 次阅读|没有评论
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双歧杆菌blast本地教程
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2021-1-10 15:46
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blastn -query 2-BIF-GROEL-F_B12.fatsa -db Bif_groEL_db -out 2-BIF-GROEL-F_B12.txt -outfmt 7 -evalue 1
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个人分类: 科研笔记|1450 次阅读|没有评论
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