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广义线性混合模型(glmm)的R2计算之二项回归
张霜 2022-7-4 22:46
首先必须明确,二项回归(binomial regression) 有两种形式,一种是针对因变量Y为0,1数据,也就是传说中的logistic 回归, 这里的自变量Y必须不是0,就是1,而不能是0-1之间的某个值,这其实是一种伯努利回归,抛硬币,记录每次的结果,就是这种模型的典型。 比如下面这个数据:这里的Colour这个变量,就是个0,1 变量,所 ...
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复杂回归模型在生态学中的应用 PPT分享
热度 2 张霜 2022-4-14 22:28
鄙人于4月8日晚受北京云超算和科盈书院邀请,做了题为复杂回归模型在生态学中的应用的报告, 介绍了一点个人经验,现在PPT分享给大家,本次直播的视频回放地址如下: 特邀讲师:张霜,中科院生态环境研究中心副研究员 分享主题:复杂回归模型在生态学中的应用 直播平台:bili ...
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广义线性混合模型(GLMM)伪泊松回归的R2计算
热度 1 张霜 2022-3-29 22:51
前面的博文给大家介绍了一般线性混合模型和广义线性混合模型中泊松回归时R2的计算方法,今天跟大家聊下GLMM模型中的伪泊松回归中的R2计算问题。首先我们必须清楚两点, 1)伪泊松是用来分析自变量对计数数据的影响的,所以因变量Y必须是计数数据。 2)对于计数数据,理论上,泊松模型假设其均值=方差。但事实上,现实数 ...
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广义线性混合模型之泊松回归模型的R2计算
热度 1 张霜 2022-2-25 22:07
上次跟大家聊了下线性混合模型(lmm)的R2计算方法,这次我们进入稍复杂点的情况,广义线性混合模型(glmm)的R2计算方法。今天我们给大家介绍下,当你的数据为计数数据(count data即数据都为非负整数)的时候,GLMM模型R2的计算方法。对于计数数据, 有几种分布模型可供选择:泊松,伪泊松,负二项,零膨胀等等。我们今天 ...
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混合模型的R2到底是如何计算的?
张霜 2022-2-20 10:53
伟大的革命导师鲁迅他老人家早就教导我们“尽信R, 则不如无R”!软件本身是傻的,你输入命令,他就输出结果,至于模型是否合适,结果是否可信,甚至是对还是错,大家可能并不真正了解。 最近跟植物所赖江山老师测试他新开发的glmm.hp包(这个包主要用于混合模型中多元回归时R2在不同因子间的分解),自己也再次学习 ...
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混合效应模型 — 独步科研江湖数据分析工具
张霜 2021-4-27 22:45
列位看官,现在是否觉得你在统计课上学的那些模型( one way anova, 线性回归,卡方检验 … ) 在实际研究中已很少用到呢?如果要问你当前应用范围最广、情景适用能力最强的通用性统计模型是哪个,答案会是什么呢? 别的领域我不敢讲,但至少在传统生态学领域,这个答案非常确定,这就是混合效应模型(也称多水平模 ...
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正态性——数据分析中的第一误区
张霜 2021-4-11 22:31
今天跟大家聊聊应用统计中一个非常基础,却又非常容易让让人感到困惑与头疼的问题,那就是正态性。 正态性的基本概念想必大家都清楚,比如一组数据,如果其频率分布跟下图类似,那么这组数据就较接近正态分布 。在 R 中,我们也可以非常方便的用 shapiro.test() 命令来对某一变量是否符合正态分布进行检验。 ...
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[转载]数据分析中的常见问题与应对方案公开课
张霜 2020-11-14 23:22
本人将于11月15日(周日)晚8点做一个题为“数据分析中常见问题与应对方案”的直播公开课,欢迎广大科研同行一起交流。直播观看方式如下:
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PPT分享:Meta分析的原理与要点
张霜 2020-10-19 20:34
应广大同行们的要求,现将鄙人上周五(10月16日)晚的线上公益讲座“Meta分析的原理与要点”的PPT分享给大家。如果有大家对PPT的内容有任何疑问,欢迎留言与本人交流。
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一种简单易行的方差分解方法
热度 2 张霜 2020-10-10 00:09
此前的博文中,给大家介绍了如何用几个圆圈来进行方差分解的方法,但事实上该方法依然有一定的复杂性,且几个圈交汇处的方差并不太容易解释。 那么有没有更简单一点的方法,能够方便的对比回归模型 Y=b0+b1*x1+b2*x2+… 中x1, x2, x3…对Y贡献的相对大小,以及不同X所属的因素类别(如生物因素,非 ...
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