EI：南土所褚海燕组发现农业土壤微生物核心菌群能够提升土壤生态功能

刘永鑫 2020-6-26 00:07

农业土壤微生物核心菌群能够提升土壤生态功能 Abundance of kinless hubs within soil microbial networks are associated with high functional potential in agricultural ecosystems Environment International Impact Factor 7.943 DOI： https://doi.org/10.1016/j.envint.2020.105869 发表日期：202 ...

个人分类: 读文献|6915 次阅读|没有评论

212.样本量和测序深度的Alpha多样性稀释曲线

刘永鑫 2020-6-22 22:37

样本量和测序深度的Alpha多样性稀释曲线 本节作者：刘永鑫，文涛 版本1.0.1，更新日期：2020年6月22日 本项目永久地址： https://github.com/YongxinLiu/MicrobiomeStatPlot ，本节目录 212RareCurve，包含R markdown(*.Rmd)、Word(*.docx)文档、测试数据和结果图表，欢迎广大同行帮忙审核校对、并提修改意见。提交 ...

个人分类: 微生物组专著|14565 次阅读|没有评论

NAR：宏基因组网络分析工具MetagenoNets

刘永鑫 2020-6-16 10:27

MetagenoNets：微生物相关网络的综合推断和整合见解 MetagenoNets: comprehensive inference and meta-insights for microbial correlation networks Nucleic Acids Research 2020-04-27 Web Server DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkaa254 第一作者：Sunil Nagpal, Rashmi Singh, Deepak Yadav ...

个人分类: 读文献|4011 次阅读|没有评论

Microbiome：南京农大团队在粘细菌捕食的生态学功能方面取得重要进展

刘永鑫 2020-6-9 20:40

掠食性粘细菌通过调节土壤微生物群落来控制黄瓜枯萎病 A predatory myxobacterium controls cucumber Fusarium wilt by regulating the soil microbial community Microbiome Impact Factor 10.465 DOI： https://doi.org/10.1186/s40168-020-00824-x 发表日期：2020-04-06 第一作者：叶现丰 1† , ...

个人分类: 读文献|2476 次阅读|没有评论

Microbiome：华中农大谢卡斌组利用CRISPR系统改进16S rRNA基因测序宿主污染问题

刘永鑫 2020-6-9 19:04

利用CRISPR/Cas9系统可减少基于16S rRNA基因扩增子测序中大量的宿主污染 Engineering CRISPR/Cas9 to mitigate abundant host contamination for 16S rRNA gene-based amplicon sequencing Microbiome Impact Factor 10.465 DOI： https://doi.org/10.1186/s40168-020-00859-0 发表日期：2020-06-03 第 ...

个人分类: 作者解读|4549 次阅读|没有评论

211.Alpha多样性箱线图(样章，11图2视频)

刘永鑫 2020-6-8 00:09

《微生物组数据分析与可视化实战》专著 众筹编写《微生物组数据分析与可视化实战》——成为宏基因组学百科全书的创始人(目录) 编者序：初衷、计划、要求、优势、目标和展望 本文为样章，211代表目录中的第二章，第一节的第一部分，部分引用格式文字为格式说明。 每节的基本逻辑：背景知识 —— 实例解读 —— ...

个人分类: 微生物组专著|8649 次阅读|没有评论

编者序：初衷、计划、要求、优势、目标和展望

刘永鑫 2020-6-5 22:19

020编者序 写在前面 2020年4月底，宏基因组公众号编辑部内部启动了《微生物组数据分析和可视化实战》专项计划(又名《宏基因组学百科全书》)，该项目是对2017年以来宏基因组公众号发布的上千篇原创文章进行系统的总结和更新，希望在接下来一年以时间里，初步形成一套对本领域新人入门的教材，同时是专业同行查找相关资源 ...

个人分类: 读文献|1693 次阅读|没有评论

本页有 3 篇博文因作者的隐私设置或未通过审核而隐藏