博文
- 阿里云服务器
- 了解了一下，这次没用上，备用。 （1）申请注册阿里云。 网址： https://cn.aliyun.com/ ; 各类产品见网站说明。例如 https://help.aliyun.com/document_detail/25422.html?s ...
- 寻找合适的Cas9靶位点的脚本
- 解释： 此脚本的目的是寻找一些Cas9靶位点，他们要满足如下条件： （1）只存在于某一条染色体上（修改后可变化），并且频数大于某一值。 （2）至少有一段靶位点在指定的区域。 返回的结果就是这些靶位点的序列，以及它对应的位置。 这个脚本是用作用cas9标记某一染色体的特定位置。 ################ ...
- Python练习
- Python练习 (1)生成随机序列 (2)反向互补序列 (3)查找序列 (1)生成随机序列 #########生成随机序列############# def RandomSeq(SeqLength): #import random #import myT = myRT = list(range(0,int(SeqLength))) i = -1 while len(myT) Seq ...
- Ubantu乌班图python2.7 处理的文本，以及脚本中的 中文 的解码
- Ubantu乌班图python2.7 处理的文本，以及脚本中的 中文 的解码 ########################################################################## 在linux中（乌班图）中，python2.7在处理中文文本，并且脚本中含有中文时 1， 在脚本的首行加 # -*- coding: UTF-8 -*- 2， python在读入中文时，将文 ...
- SRA数据的下载
- SRA 数据的下载 （1）SRA 数据链接 https://ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/ 里面有三个目录 ，SRR，DRR，ERR。 网页上找到你想要下载的 SRA 数据 ...
- 利用R软件包ggplot2绘制boxplot图
- 利用 R 软件包 ggplot2 绘制 boxplot 图 数据集 ： 三个阶段卵母细胞 （NSN，NSN-SN，SN） 的核内组蛋白集落 （ 分大小 ，large foci，small foci） 的数量 。 一般而言 ，ggplot2 需要的数据 ， 每个样本为一行 ， 样本信息需要有观测值 ， 以及样本的属性信息等 。 文件名 ...
- Bioconductor中DESeq2的用法
- Bioconductor 中 DESeq2 的用法 （1） 安装 R， 安装 Bioconductor， 从略 。 （2） 安装 DESeq2。 在 Ubantu 安装 DEseq2 会报错 。 主要是在安装 DEseq2 依赖的 Matrix 时出问题 ， 显示 /usr/bin/ld: cannot find llapack 等 。 以此为例 ， 可以在 Ub ...
- 乌班图操作系统与软件的安装
- 乌班图操作系统的安装 （1） 乌班图优麒麟系统 ： “ 优麒麟 （Ubuntu Kylin） 是由中国 CCN（ 由 CSIP、Canonical、NUDT 三方联合组建 ） 开源创新联合实验室与天津麒麟信息技术有限公司主导开发的全球开源项目 ， 其宗旨是通过研发用户友好的 ...
- 转录组数据的分析
- 转录组数据的分析 （1） 转录组测序 ， 以两组比较实验为例 ， 实验组为 T， 对照组为 C， 每组三个重复 ，T1，T2，T3，C1，C2，C3。 诺禾致源返回的文件为 T1_1_clean.fq，T1_2_clean.fq，T2_1_clean.fq，T2_2_clean.fq，T3_1_clean.fq，T3_2_clean.fq，C1_1_clean.fq，C1_2_clean. ...
