自己翻译的Gromacs教程（Protein-Ligand动力学模拟-4） 2015-01-21

（十二）体系平衡 1.设定对配体的限制： $gmx/genrestr -f jz4.gro -o posre_jz4.itp -fc 1000 1000 1000 ** -f jz4.gro 输入配体的gro文件 ** -o posre_jz4 ...

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自己翻译的Gromacs教程（Protein-Ligand动力学模拟-3） 2015-01-21

（九）设定能量最小化的配置文件em_real.mdp 用记事本编辑如下参数，保存为em_real.mdp： ; LINES STARTING WITH ';' ARE COMMENTS title   &n ...

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自己翻译的Gromacs教程（Protein-Ligand动力学模拟-2） 2015-01-21

（四）添加盒子 $gmx/editconf -f complex.gro -o newbox.gro -bt dodecahedron -d 1.0 ** -f 输入复合物的gro文件 ** -o 输出含盒子的结构文件，newbox.gro ...

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自己翻译的Gromacs教程（Protein-Ligand动力学模拟-1） 2015-01-21

Gromacs蛋白-配体动力学模拟教程： 原文：http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin/gmx-tutorials/complex/index.html 设定环境变量：exp ...

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