博文
- 一个简洁的子集获取的代码
- 刚读文献的时候，发现一个提取数据框子集的代码很简洁的代码，特此记录下来。 GuineaPigs - subset(GuineaPigs, !is.na(Testo) !is.na(Rank) (Time %in% c(1,3,5))) 此代码的目的是去掉 GuineaPigs数据钟 Testo和Rank中这两列中含有NA的行，并选取Time里面是1，3，5的行。 虽然我们很多的命令可以实 ...
- 用于分解广义混合线性模型的R2的包glmm.hp发布于R官网CRAN
- 生态学的数据大部分取样于地球表面，常常具有时空属性或复杂的嵌套和层次结构，导致数据点之间不独立的问题普遍存在，传统的普通线性模型对类数据并不适用。 线性混合效应模型（ LMM ）及广义线性混合效应模型 (GLMM) 允许我们明确地对这种数据中的非独立性进行建模，因此 ...
- rdacca.hp包的文章在线发表Methods in ecology and evolution
- https://besjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/2041-210X.13800 如何确定典范分析（RDA,CCA和dbRDA）单个解释变量的相对重要性，相信很多人跟我一样一直在寻找方法，但是一直没找到满意的答案。不少人用简单效应（simple effect）、条件效应（conditional effect）或是边际效应（marginal effect）直接当作 ...
- R里面save(对象1,对象2..., file="文件名.Rdata")这命令一定要习惯常用
- 很多R的初学者有个习惯的思维，总要把结果输出到excel表格来，实际上除了数据框或是正常矩阵这种少数的类别能够往外输出到excel外，其他一般是无法这样输出的。最简单，最常用的存储结果的方式就是save(对象1,对象2..., file=文件名.Rdata)这个命令，这样存储的结果是在当前工作目录下有个R的文件，下回你直接打开这 ...
- R语言在光合作用研究当中的应用分析（Functional Plant Biology）
- R 语言在光合作用研究当中的应用分析 Yasi Liu , Xiangping Wang , Dayong Fan * , Jiangshan Lai * & ...
- 用unique去掉重复的列的用法
- 刚有一学员问怎么将相同的列去掉，很多人知道unique函数能去掉相同的行，但不知道也能去掉相同的列，只不过需要设定参数MARGIN=2，还有将数据对象设为矩阵而已。 a=data.frame(a=1:4,b=1:4) a a b 1 1 1 2 2 2 3 3 3 4 4 4 unique(a,MARGIN=2) #无动于衷，因为a是个数据框 a b 1 1 1 ...
- 结构方程模型中类别变量变为定量数据的处理方法建议
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- 在SEM中，经常遇到想要将 不同的组别 （不同植被类型，土地利用方式）、 不同的处理 （比如专门设计的配对试验，如施肥不施肥两种处理）作为外生的变量（解释变量）纳入SEM的情况。目前一般情况下将类别变量的每个水平单独做解释变量（变为0-1数据）然后进行SEM分析，这样无法获得整个类别变量作为单一的外生变量（解释变 ...
- 评价R语言在生态学研究中应用的Ecosphere文章目前被引用的情况
- 2019年在Ecosphere发表的一篇基于文献调查的评价R语言在生态学研究中应用及对生态研究开放性的贡献的文章，到目前google引用已经达到47次，通过researchgate可以展示具体被文章被引用的地方，基本引用都是为了证明R语言在生态研究中的重要性，为自己的研究工作或是R包的必要性提供依据。 1. &n ...
- 如果用双循环把两层文件夹里面的数据读到一个文件里面（代码）
- 应朋友请求，需要将案例数据里面的一个文件夹里面n个文件夹里面m个文件（每个文件列名一样，行数不一样）一起读入R并组成一个文件。 通过这个案例可以巧妙利用双循环进行读取。具体案例和代码从百度网盘获取。大家运行的时候得预先注意一下工作目录。 链接: https://pan.baidu.com/s/1jNL-T7mozeH5-WDflP5TOA 提取码: af ...
- 新疆生地所2021年9月10日讲座：用rdacca.hp包获取典范分析中单个解释变量的解释率（ppt和代码）
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- 新疆生地所讲座代码.r 新疆生地所：用rdacca.hp包获取典范分析中单个解释变量的解释率.pdf
