广义可加模型（GAM，Generalized Additive Models）是一种具备高度灵活性和自由度的非线性回归统计模型。先前我个人倾向于将其应用于预测可能更有用，因其准确性颇受信赖。然而，当涉及到解释性方面时，我曾对其适用性抱有疑虑，总觉得可能存在过拟合的现象，使得mgcv包中GAM给出的校正R²（r.sq）和被解释离差比例（explained deviance）等指标在实际应用中显得不那么有说服力。但最近一位来自广州气象局的工程师联系我，表达了对于了解GAM中各变量相对重要性的需求，他希望能像对广义线性混合模型（GLMM）用glmm.hp分解那样，得到各预测变量单个的解释比例。用户的需求，始终是我们不断前进的动力。我们继续将“平均共享方差”的思想（Lai et al. 2022,2003）拓展至GAM模型，并推出了全新的gam.hp包，现已新鲜出炉并上传至CRAN及github平台（已经可以正常安装下载），或是百度网盘下载本地安装（pan.baidu.com/s/1bzkJJuPOZvW_XIoz_I9BGw 提取码: gp4x）。我们诚邀各位用户安装并尝试运行此包，体验其带来的新功能，以对gam模型的深入理解。

由于GAM的预测部分支持多种复杂且多变的光滑模式，我们尚不能完全确定当前函数是否能够应对所有情况。因此，我们恳请各位用户在使用的过程中，提供宝贵的反馈意见，帮助我们不断优化和完善。若有任何问题或建议，欢迎通过电子邮件与我联系：lai@njfu.edu.cn。gam.hp()函数有三个参数：mgcv包中gam函数输出的模型对象、type参数（用于定义输出类型为adjR2或dev，默认为dev），以及一个逻辑参数，用于控制是否输出commonality分析结果。此外，我们还提供了S3泛函数plot()进行绘图，还有置换检验函数permu.gamhp()帮助用户获取individual effect的p值。需要强调的是，这个p值仅作为参考，用户可根据实际情况选择是否采纳，它并不作为变量影响是否显著的诊断依据。为了方便大家快速体验gam.hp包的功能，附上了简单的安装及测试代码。期待与您一同探索“平均共享方差”这一理论更多的拓展，共同推动统计模型的发展与应用。

#library(devtools)

#install_github('laijiangshan/gam.hp',build_vignettes = TRUE)

install.packages("gam.hp")

library(gam.hp)

dat<-gamSim(1,n=400,dist="normal",scale=2)

b<-gam(y~s(x0)+s(x1)+s(x2)+s(x3),data=dat)

bt<-gam(y~s(x0)+s(x1)+s(x2)+s(x3)+ti(x1,x2,k=6),

data=dat,method="REML")

gam.hp(mod=b,type="dev")

gam.hp(mod=bt,type="adjR2")

permu.gamhp(b,permutations=100)

plot(gam.hp(mod=b,type="dev"))

参考文献：

1.Jiangshan Lai*, Yi Zou, Jinlong Zhang, Pedro R. Peres-Neto. 2022. Generalizing hierarchical and variation partitioning in multiple regression and canonical analyses using the rdacca.hp R package. Methods in Ecology and Evolution,13:782-788

2. Jiangshan Lai*, Yi Zou, Shuang Zhang, Xiaoguang Zhang. Lingfeng Mao.2022. glmm.hp: an R package for computing individual effect of predictors in generalized linear mixed models. Journal of Plant Ecology 15(6)：1302-1307. https://doi.org/10.1093/jpe/rtac096.

3. Jiangshan Lai*, Weijie Zhu, Dongfang, Cui, Lingfeng Mao. 2023. Extension of the glmm.hp Package to Zero-Inflated Generalized Linear Mixed Models and Multiple Regression,Journal of Plant Ecology  16(6):rtad038,  https://doi.org/10.1093/jpe/rtad038