模拟一套数据, 5个世代, 最后三代有基因型数据, 每个世代400个个体, SNP为50K 1. blupf90构建G矩阵的PCA blupf90如果想要进行GBLUP分析, 不写系谱信息即可, 示例par文件: DATAFILE dat_f90.txt TRAITS 10 # This is column 10 (phenotype) from QMSim data file FIELDS_PASSED TO OU ...
之前翻译了一篇博文 R中的线性混合模型介绍(翻译博客) , 但是里面的示例代码显示不友好, 今天重新整理. 数据来源: MASS软件包的oats数据 oats数据, 这是一个燕麦的裂区试验数据, 主区是品种, 裂区是施肥N, 重复是B区组, 观测值是产量Y The yield of oats from a split-plot field trial using three varieties and f ...
GWAS分析中表型值是使用BLUE值还是BLUP值? https://www.researchgate.net/post/Does_any_one_have_an_idea_of_which_one_BLUE_or_BLUP_to_use_for_a_GWAS_analysis_of_a_trait_in_wheat_eg_resistance_to_rust 问题 Does any one have an idea of which one, BLUE or BLUP, to use for a GWAS analysis of a tra ...