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批量将seq格式文件转为fasta格式文件

已有 4526 次阅读 2021-7-17 10:22 |个人分类:软件|系统分类:科研笔记

需要软件:DNASTAR,cygwin及可靠的大脑,哈哈哈哈!

  1. 第一步利用DNASTAR下的EditSeq将多个seq格式文件转为一个fasta文件。

    直接拖入,选择just open

    图片.png点击file-export all to one,导出为all.fasta文件

    图片.png

  2. 第二步,将all.fasta文件分解为单个fasta文件

    运行seqkit split -i all.fas即可

    图片.png至此将seq文件批量转换为fasta文件。

  3. 另外推荐一个windows系统可以进行linux操作的软件包(cygwin),就是本文中第二部分用到的。

    安装cygwin的步骤参考:cygwin安装



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