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批量将seq格式文件转为fasta格式文件

已有 11968 次阅读 2021-7-17 10:22 |个人分类:软件|系统分类:科研笔记

需要软件：DNASTAR，cygwin及可靠的大脑，哈哈哈哈！

第一步利用DNASTAR下的EditSeq将多个seq格式文件转为一个fasta文件。
直接拖入，选择just open
点击file-export all to one，导出为all.fasta文件
第二步，将all.fasta文件分解为单个fasta文件
运行seqkit split -i all.fas即可
至此将seq文件批量转换为fasta文件。
另外推荐一个windows系统可以进行linux操作的软件包（cygwin），就是本文中第二部分用到的。
安装cygwin的步骤参考：cygwin安装