科学网

 找回密码
  注册
看起来简单,做起来难
马省伟 2014-11-10 17:55
最近在处理snp标记,需要对1万左右的snpmaker进行标记定位,本来打算用mapmaker,结果数量有限制,试用了一些其他软件,结果也不是很理想,闫双勇老师实验室的软件可以用,当标记距离很近时,标记顺序会出错。最后没办法,先把标记按染色体分,然后再用mapmaker3.0,结果运行起来花很多时间。有更好的解决方 ...
2748 次阅读|没有评论
提取指定位置的序列 extract fasta sequence by their position
热度 1 马省伟 2014-11-9 17:12
我们要获得100个基因的启动子序列(ATG上游2k),我知道了这些基因atg的位置。 我习惯举例子来说明问题,小麦3B染色体序列我们已经有了,fasta格式 ,格式如下: 3B CAACCAGAAAATTCTTTGGTAGGCATGAAGGTCTCTGTCACTTGTTCGCCGTTGCTTCAA ATAATAAAGATCAATTATGCTGATTTTGTTGGGCCTAATACAAACTTGATTTAC ...
8607 次阅读|1 个评论 热度 1
开篇
热度 2 马省伟 2014-11-9 16:49
终于在高大上的科学网上注册了一个用户,以前一直来看前辈的博客,很多朋友经常更新,在下很佩服,说这话是因为这种事情我做不来,今天更新,下次就不知道哪年了。后来想想,从别人那里讨教了很多知识,应该分享下自己的学习体会。闲话不多说,首先要做个自我介绍,给大家留个印象。 &nb ...
2422 次阅读|3 个评论 热度 2

本页有 1 篇博文因作者的隐私设置或未通过审核而隐藏

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2023-1-29 20:57

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部